应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 会用vfin.pl这个脚本的高手进来！
61/1返回列表
查看: 2290  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 会用vfin.pl这个脚本的高手进来！ 已有1人参与

各位前辈，大家好：
最近在用vasp算过渡态时，遇到了vfin.pl 这个脚本，但我不知道它怎么用，当我在计算的当前目录下，运行这个命令时，它出现了error：no output directory given。 这的意思难道是说这个脚本不能在当前目录下运行？那它到底怎么运行？还望大牛们指导呀，不胜感激！
回复此楼

» 猜你喜欢
好好研究，天天向上！
1楼 2014-07-01 18:06:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuraining

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小小鑫000: 金币+5 2014-07-02 11:32:03
vfin.pl 后面应该有一个目录名，这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里，原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了，可以进一步作为NEB计算的输入文件
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2014-07-01 19:36:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yuraining at 2014-07-01 19:36:16
vfin.pl 后面应该有一个目录名，这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里，原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了，可以进一步作为NEB计算的输入文件

前辈，谢谢您的指导，那我是不是可以在第一遍粗算过渡态后，只用一下这个命令，别的什么都不用管，来进行下一步精算了？
赞一下 回复此楼
好好研究，天天向上！
3楼2014-07-02 11:50:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuraining

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小小鑫000: 金币+5 2014-07-03 10:58:00
差不多是的，只需要修改INCAR文件里面的优化参数，粗略优化时：
IBRION=3
EDIFF=0.0001
EDIFFG=-0.1
POTIM=0
IOPT = 3，
完成后用vfin.pl命令生成新的POSCAR
再修改
EDIFF=0.00001
EDIFFG=-0.02
IOPT = 1
其中EDIFF和EDIFFG根据自己的体系修改
IOPT的具体算法可以看官网的说明：
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/optimizers.html
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2014-07-02 21:20:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张丽芙

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yuraining at 2014-07-01 19:36:16
vfin.pl 后面应该有一个目录名，这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里，原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了，可以进一步作为NEB计算的输入文件

请问后边这个output directory怎么写呢？
赞一下 回复此楼
5楼2016-01-18 22:09:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

浪心99

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 张丽芙 at 2016-01-18 22:09:00
请问后边这个output directory怎么写呢？...

你好，你的这个问题我也遇到了，Error: No [Output Directory] given.
usage: /ICME/wsliu-ICME/bin/vtstscripts/vfin.pl [Output Directory]  请问你是怎么解决的呢
赞一下 回复此楼
6楼2016-07-05 11:16:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小小鑫000 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 人气不行了 +9 fansofjerry 2026-08-21 9/450 2026-08-24 17:48 by zhaozhengxin
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +6 图啦图啦 2026-08-24 6/300 2026-08-24 17:44 by 小小红帆
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +5 scalable 2026-08-24 5/250 2026-08-24 17:03 by spiderzhuzhi
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +19 koalala 2026-08-24 21/1050 2026-08-24 16:48 by Wei_ren
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 估计是周四 +4 archvillain 2026-08-18 4/200 2026-08-24 13:53 by zzuzxg
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 明天应该可查了！？ +4 chengyan1220 2026-08-23 4/200 2026-08-24 08:47 by gloomy6159
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭