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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 新骨架类化合物生物合成途径如何研究
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syn1985

木虫 (正式写手)

[求助] 新骨架类化合物生物合成途径如何研究已有1人参与

我现在的课题是研究一个新骨架生物碱化合物的生物合成途径，这株菌的基因组已经测序，c-13标记也做了，确定化合物骨架来自于乙酰辅酶A，生成聚酮后再修饰，但基因组中pks有很多，不知怎么确定目标基因，有点盲目，望有大虾可以指点一下。
P.S. 有没有什么好的分析网站可以推荐一下

[ Last edited by syn1985 on 2014-6-27 at 15:24 ]
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1楼2014-06-27 09:10:47
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syn1985

木虫 (正式写手)
为什么没有人回复啊
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2楼2014-06-27 19:42:41
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weigh1111

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你们这个菌方便做遗传操作么？如果方便的话直接敲除PKS基因呗，然后看看发酵后还产不产
其实虽然pks基因很多，但是有些很小，有些产物已知，大概扣除之后可能的选项不是很多，如果上面还有特殊修饰的话，找找看哪个PKS周围有对应的修饰酶，很有可能就是那个基因簇
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3楼2014-07-01 16:32:11
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