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playboy723

金虫 (正式写手)

[交流] PCR的问题

请教各位:
我最近要构建一个载体,大概有1500bp左右,然后我用普通的Tag酶可以扩得出来,可是我用高保真的exTaq酶扩时却怎么也扩不出来,连内参GAPDH也扩不出来,我可以确定模板没有问题,请问各位遇到过这样的问题吗?我该怎么办?继续用普通Taq扩?可这样的错配会很多,即使连到载体上后续的测序也会很麻烦的,求教了。
为什么普通Taq酶可以扩出来而exTag反而扩不出来呢   请赐教  谢谢!!
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weiwei1

木虫 (小有名气)

★
asr(金币+1,VIP+0):thank u!
1500bp,错配也不至于很多吧.个人认为还是体系的问题
2楼2008-03-27 09:27:41
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碧荷叶

铜虫 (初入文坛)

你用过Pfu酶吗?也是一种高保真PCR用酶。它有外切酶活性,会降解引物,引物要加大用量。你的exTaq有外切酶活性吗?个人认为可以试一下加大引物量。
3楼2008-03-27 09:38:39
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wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户

★
asr(金币+1,VIP+0):thank u! 欢迎常来o(∩_∩)o...
Taq的错配几率大概是千分之一吧,所以1500bp的片段可能会出现错配的碱基。如果用高保真酶扩不出来的话,就用Taq试试吧。有些时候就是这样,酶都是挺变态的东西。注意3·加A的问题。最好还是继续优化条件。
金币是赌出来的
4楼2008-03-27 13:28:04
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playboy723

金虫 (正式写手)

是  我是要连到T载体上的  所以有些种类的高保真酶还不能用,很郁闷,所以还是倾向于继续用exTaq酶。我就想请教一下大家有遇到这种情况的吗  如果有该怎么办呢?
5楼2008-03-27 15:10:20
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)

换个新的吧,可能你的酶本身就有问题。
6楼2008-03-27 15:14:43
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gyxleo

铜虫 (初入文坛)

★
asr(金币+1,VIP+0):这么做过吗?效果明显?
建议两种酶同时用,rTaq:pfu为1:3或者1:4,用pfu的buffer即可。
追求卓越,尽善尽美,不断完善自己。
7楼2008-03-27 22:21:45
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playboy723

金虫 (正式写手)

呵呵  6楼得主意很好,我得试试   呵呵 谢谢啊
以前你这样做过吗?很有开创性的主意啊!!!
8楼2008-03-28 10:03:55
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glenn_007

木虫 (小有名气)

有没有人用两种酶试试啊
很期待这个想法的结果
9楼2008-03-29 16:15:07
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sunbinice

银虫 (初入文坛)

6楼的你这样做过?想试试啊呵呵呵
10楼2008-03-29 18:35:13
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