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qincaiyan615

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教各位,micRNA预测在mRNA上的靶位点必须在3‘UTR区吗,能在CDS区吗 已有1人参与

请教各位,micRNA预测在mRNA上的靶位点必须在3‘UTR区吗,能在CDS区吗
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飞约疯人院

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科学怪人

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qincaiyan615(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-23 18:32:08
首先,你提到了UTR这个概念,但是只有mRNA上才有UTR的定义。如果DNA没有转录,就无所谓UTR。所以无论5’还是3’,都已经是DNA转录之后的事情了。

其次,miRNA属于转录后调控,转录后调控的方式有很多,而且这些调控是不能在转录前进行的。机体是一个精密而复杂的系统,虽然我们现在的科学还不能解释很多东西,但这样的系统是经过自然选择的,必然有他的道理。不能说这些调控方式是浪费。

最后,现在miRNA的机制也并不十分清楚,已经有报道miRNA可以作用于mRNA的5’端甚至coding region。你可以找找相关的文献。
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
2楼2014-06-23 14:22:57
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jjheng

新虫 (初入文坛)

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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-06-24 08:29:58
目前大部分的靶点位于mRNA的3‘UTR区,可以去搜搜文献看一下能不能提供更多的证据
3楼2014-06-23 14:33:49
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yangfanv

铁虫 (小有名气)

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qincaiyan615(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-23 18:32:18
肯定可以啊~都有文章报道过的了~像miR-130a调控HOXA5就在其CDS局域~~只是miRNA大部分都是通过target mRNA的3‘UTR来调控的~楼上的说的很对~也有报导miRNA 靶定mRNA的5’UTR的
路要慢慢地走~但不能停
4楼2014-06-23 14:36:11
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这是一个悖论,就是实验科学中实验与理论的关系,生物学。。。凑合一个实验科学吧
预测靠得是理论,但是当理论不健全不全面不完善甚至不对的时候,预测没有意义,这是现在做湿实验的鄙视做干实验的依据,比如各种预测,不测白不测,测了也白测是也!
理论来自实验,但是一方面孤立不存,另一方面研究程度不深,能够用于“抽象”理论的实验基础不多,所以即便爱因斯坦是学生物的,他也总结不出什么高神理论,生物学就在这个两眼一抹黑的黑色积累时代,历史局限性使得搞生物的人不能太依赖逻辑,凡是只有靠试——实验科学早期都是这样的,在生物学,你抛一个苹果,说不定就会飞向月亮。。。现在做干实验的人,唯一可以说服做湿实验的,最不可抗拒的是通量,即便如此,其结果的有效性往往大打折扣。
所以,什么miRNA位点预测。。。如果你只有这一条路可以走,一个一个去试吧,如果还有其他路可以走,最好再想想。
5楼2014-06-24 09:36:08
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