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如何判断DNA大沟槽的深浅~~
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poly d(A)•poly d(T), poly d(AT)•poly d(AT), poly d(AG)•poly d(CT), poly d(AC)•poly d(GT) and poly d(GC)•poly d(GC) and random dsDNA, 这些双链DNA, 长度均为24bp ,B-DNA。 我目前做的课题 ,急需验证 上述六种DNA 大沟槽区别。 请问大家:如何判断DNA大沟槽的 深浅~~ 有什么数据库 可以模拟出 DNA的三维形态吗? 然后根据模拟结果给出相关数据? 个人认为 poly d(AT)•poly d(AT) 大沟槽应该最深 晶体数据表明: B-DNA (大沟槽深 ) Z-DNA (大沟槽浅,几乎无) 而在B-DNA中 GC-rich的 易转换为 Z-DNA, AT-rich 最难, 但是 没有文献 表明: 在B-DNA中 poly d(AT)•poly d(AT)的大沟槽 相比其他DNA的 大沟槽更深~~~ |
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