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Delux_red

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何判断DNA大沟槽的深浅~~

poly d(A)•poly d(T), poly d(AT)•poly d(AT), poly d(AG)•poly d(CT), poly d(AC)•poly d(GT) and poly d(GC)•poly d(GC) and random dsDNA,

  这些双链DNA, 长度均为24bp ,B-DNA。
我目前做的课题 ,急需验证  上述六种DNA 大沟槽区别。
请问大家:如何判断DNA大沟槽的 深浅~~  有什么数据库 可以模拟出 DNA的三维形态吗? 然后根据模拟结果给出相关数据?

个人认为  poly d(AT)•poly d(AT) 大沟槽应该最深

晶体数据表明: B-DNA (大沟槽深 )  Z-DNA (大沟槽浅,几乎无)

而在B-DNA中 GC-rich的 易转换为 Z-DNA,  AT-rich 最难,

但是 没有文献 表明: 在B-DNA中 poly d(AT)•poly d(AT)的大沟槽 相比其他DNA的 大沟槽更深~~~
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Delux_red

铜虫 (小有名气)

3q, 但是没作用~~ 还是谢谢你了
2楼2014-06-07 10:14:47
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