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hxppxh版主
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Trinity使用 已有1人参与
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我看官网上的说明，Trinity assemble后的分析有这么几种：（http://trinityrnaseq.sourceforge.net/） 1 Abundance Estimation using RSEM or eXpress, and Visualization using IGV 2 Differential Expression Analysis using Bioconductor 3 Protein-coding Region Identification Using TransDecoder 4 Functional Annotation Using Trinotate 5 Full-length Transcript Analysis 我目前做了第1和第2个。 请问第三个的输入文件 -t <string> transcripts.fasta 应该是哪一步得到的？是Trinity组装得到的那个fasta文件吗？ 第4步需要用到很多软件，这些软件下载后，如何安装呢？ 第3步如何和后面的联系在一起？ 谢谢！ |
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