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curieshicy

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GULPÖÐ×Ô´øµÄÀý×ÓÖÐÖ»½éÉÜÁËÒ»¸öϵ×ÛµÄÊäÈ뷽ʽ±ÈÈçexample16

#  MD options
#
integrator leapfrog verlet
ensemble nvt 0.05
temperature 300
equil 0.5 ps
produ 0.20 ps
timestep 0.0001 ps
sample 0.01 ps
write 0.01 ps
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ÎÒÏëÇë½ÌÖîλƽºâʱÓÃNVT ¼ÆËãʱÓÃNVE ÔõôʵÏÖÄØ£¿
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oxox6085

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¸Ðл²ÎÓ룬ӦÖúÖ¸Êý +1
ÔÂÖ»À¶: ½ð±Ò+3, ¸Ðлָµ¼£¡ 2014-06-16 19:42:29
ensemble nve
ensemble nvt 0.05
ensemble npt 0.05 0.5
ÓÐЩÊÂÇé¿ÉÄÜÖ»ÓмÆËã»úÄ£ÄâÄܸæËßÎÒÃÇ´ð°¸
2Â¥2014-06-06 06:56:19
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curieshicy

Òø³æ (³õÈëÎÄ̳)

Ðè²»ÐèÒªÔÚequil 0.5ps ºÍ produ 0.20 psÖ®¼ä¼ÓÈë ensemble nve ÕâÑù³ÌÐòÖªµÀproduction ½×¶ÎÓÃnve

¡°integrator leapfrog verlet
ensemble nvt 0.05
temperature 300
equil 0.5 ps

ENSEMBLE NVE

produ 0.20 ps
timestep 0.0001 ps
sample 0.01 ps
write 0.01 ps
¡±
3Â¥2014-06-06 10:17:13
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

oxox6085

ר¼Ò¹ËÎÊ (ÕýʽдÊÖ)

¡¾´ð°¸¡¿Ó¦Öú»ØÌû

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ÔÂÖ»À¶: ½ð±Ò+1, ¹ÄÀø½»Á÷£¡ 2014-06-16 19:42:37
ÒýÓûØÌû:
3Â¥: Originally posted by curieshicy at 2014-06-06 03:17:13
Ðè²»ÐèÒªÔÚequil 0.5ps ºÍ produ 0.20 psÖ®¼ä¼ÓÈë ensemble nve ÕâÑù³ÌÐòÖªµÀproduction ½×¶ÎÓÃnve

¡°integrator leapfrog verlet
ensemble nvt 0.05
temperature 300
equil 0.5 ps

ENSEMBLE NVE

prod ...

you need to understand the difference between ensembles and equilibrium/production procedures, they are independent concepts
ÓÐЩÊÂÇé¿ÉÄÜÖ»ÓмÆËã»úÄ£ÄâÄܸæËßÎÒÃÇ´ð°¸
4Â¥2014-06-07 18:14:28
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû
Ïà¹Ø°æ¿éÌø×ª ÎÒÒª¶©ÔÄÂ¥Ö÷ curieshicy µÄÖ÷Ìâ¸üÐÂ
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