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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » ME/Gulp » 请教GULP中多个系综的输入方式
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curieshicy

银虫 (初入文坛)

[求助] 请教GULP中多个系综的输入方式 已有1人参与

GULP中自带的例子中只介绍了一个系综的输入方式比如example16

#  MD options
#
integrator leapfrog verlet
ensemble nvt 0.05
temperature 300
equil 0.5 ps
produ 0.20 ps
timestep 0.0001 ps
sample 0.01 ps
write 0.01 ps
#

我想请教诸位平衡时用NVT 计算时用NVE 怎么实现呢？
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1楼 2014-06-03 23:24:08
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oxox6085

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2014-06-16 19:42:29
ensemble nve
ensemble nvt 0.05
ensemble npt 0.05 0.5
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有些事情可能只有计算机模拟能告诉我们答案
2楼2014-06-06 06:56:19
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curieshicy

银虫 (初入文坛)
需不需要在equil 0.5ps 和 produ 0.20 ps之间加入 ensemble nve 这样程序知道production 阶段用nve

“integrator leapfrog verlet
ensemble nvt 0.05
temperature 300
equil 0.5 ps

ENSEMBLE NVE

produ 0.20 ps
timestep 0.0001 ps
sample 0.01 ps
write 0.01 ps
”
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3楼2014-06-06 10:17:13
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oxox6085

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-06-16 19:42:37
引用回帖:
3楼: Originally posted by curieshicy at 2014-06-06 03:17:13
需不需要在equil 0.5ps 和 produ 0.20 ps之间加入 ensemble nve 这样程序知道production 阶段用nve

“integrator leapfrog verlet
ensemble nvt 0.05
temperature 300
equil 0.5 ps

ENSEMBLE NVE

prod ...

you need to understand the difference between ensembles and equilibrium/production procedures, they are independent concepts
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有些事情可能只有计算机模拟能告诉我们答案
4楼2014-06-07 18:14:28
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