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lujunyan1118金虫 (小有名气)
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用高斯QM/MM算频率和QST3已有2人参与
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各位大虾,小弟有个问题。 我想用高斯的QM/MM算一个反应,高层大约100个原子,低层约500个残基。 高层用B3LYP/6-31G*。 我优化了反应物和产物,并猜测了一个过渡态,想用QST3找过渡态。但是算的时候总是说内存不够,需要3506MW。可电脑没这么多内存。为何QST3要如此之大的内存?我减少低层的残基有效吗? 另外,用QM/MM算频率的时候也经常说内存不够,但是只用QM时不会出现这个问题。 是不是QM/MM的时候,低层的频率也计算了呢?能否让高斯只计算高层的频率? 谢谢各位! ![]() |
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sobereva
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9楼2014-05-27 14:38:16
lujunyan1118
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2楼2014-05-23 16:23:48
【答案】应助回帖
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lujunyan1118: 金币+50, ★★★很有帮助 2014-05-28 17:57:51
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一般也就用QM/MM算大分子体系核心体系构型; 不知道你的计算命令具体设置,如果用dft/AMBER肯定算不了,计算量过大。 可以参考纽约大学Yingkai Zhang,他们组做地比较有心得 |

3楼2014-05-24 11:31:19
lujunyan1118
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