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泰州木虫

金虫 (小有名气)

[求助] 基因上游序列和内含子部分的序列,大小写字母是什么意思 已有1人参与

都说下载的基因序列,大写代表外显子,小写是内含子。怎么我下载的一些基因序列,内含子部分也有大小写之分啊?
从水稻基因组数据库网站 RAP-DB http://rapdb.dna.affrc.go.jp/  下载了一个基因的上游3kb序列,发现好几块大写标注的 部分。这些代表什么呢?难道是启动子的一些元件么?

请各位帮忙看看啊

基因上游序列和内含子部分的序列,大小写字母是什么意思
osTMT upstream 3kb.png
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dongge2013

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-20 13:32:40
ATG前面是5撇非翻译区,也就是5撇UTR
2楼2014-05-20 08:09:36
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泰州木虫

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dongge2013 at 2014-05-20 08:09:36
ATG前面是5撇非翻译区,也就是5撇UTR

不好意思啊,那个ATG 不是起始转录位点。这3000bp都是基因5‘UTR上游的序列. 我是不知道5’UTR上游那些分大小写是什么意思
just do it!
3楼2014-05-20 17:13:50
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