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lifeisall

铜虫 (小有名气)

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[求助] amber里的.rst输出文件增倍

我的mdin文件如下：
dhfrc1 nvt

&cntrl

  ievb=1,
  imin=0,
  ntmin=0,
  nstlim=1,
  dt    = 0,
  irest  = 0, ntx=1,
  cut=12.0,
  ntpr = 1, ntave=1,
  ntwr = 1, ntwx = 1, ntwe = 1,
/
&ewald
  nfft1 = 120, nfft2 = 120, nfft3 = 120,
/

EVB的group file 文件如下：

#  Diabatic state 1
-O -i mdin -p dhfrc1cut.prmtop -c dhfrc1-nvt.rst -o mr.out -r new-dhfrc1-nvt.rst -evbin dhfrc1.evb
#  Diabatic state 2
-O -i mdin -p dhfrc2cut.prmtop -c dhfrc1-nvt.rst -o mp.out -r new-dhfrc1-nvt.rst -evbin dhfrc2.evb

然后我的新坐标文件，即 new-dhfrc1-nvt.rst 的行数是新坐标文件 dhfrc1-nvt.rst 行数的2倍，且后半段坐标都是0，请问有遇到的吗？

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1楼 2014-05-19 15:33:05

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Amber10作业正常提交，但是无".mdcrd"和".rst"结果文件生成已经有4人回复

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