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amber里的.rst输出文件增倍
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我的mdin文件如下: dhfrc1 nvt &cntrl ievb=1, imin=0, ntmin=0, nstlim=1, dt = 0, irest = 0, ntx=1, cut=12.0, ntpr = 1, ntave=1, ntwr = 1, ntwx = 1, ntwe = 1, / &ewald nfft1 = 120, nfft2 = 120, nfft3 = 120, / EVB的group file 文件如下: # Diabatic state 1 -O -i mdin -p dhfrc1cut.prmtop -c dhfrc1-nvt.rst -o mr.out -r new-dhfrc1-nvt.rst -evbin dhfrc1.evb # Diabatic state 2 -O -i mdin -p dhfrc2cut.prmtop -c dhfrc1-nvt.rst -o mp.out -r new-dhfrc1-nvt.rst -evbin dhfrc2.evb 然后我的新坐标文件,即 new-dhfrc1-nvt.rst 的行数是新坐标文件 dhfrc1-nvt.rst 行数的2倍,且后半段坐标都是0,请问有遇到的吗? |
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