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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 请问如何画 高聚物分子链的螺旋形构象
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扶苏不灭

铜虫 (小有名气)

[求助] 请问如何画 高聚物分子链的螺旋形构象 已有1人参与

如题，请问如何画分子链的螺旋形构象，比如10 3螺旋或者31螺旋等等。
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我是萨比，我就是大萨比
1楼 2014-05-19 11:15:01
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-30 19:08:12
是聚乳酸吗？一般高聚物出现规则helix构象的时候是晶体，去找有关该聚合物晶体结构的文献，里面有坐标及晶胞参数
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-05-19 13:31:53
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+5, 感谢指导！ 2014-05-30 19:08:27
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2014-05-19 13:31:53
是聚乳酸吗？一般高聚物出现规则helix构象的时候是晶体，去找有关该聚合物晶体结构的文献，里面有坐标及晶胞参数

这是一个31-helix的构象，找文献坐标建的

请问如何画 高聚物分子链的螺旋形构象

请问如何画 高聚物分子链的螺旋形构象-1

请问如何画 高聚物分子链的螺旋形构象-2
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3楼2014-05-19 13:51:46
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扶苏不灭

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2014-05-19 13:31:53
是聚乳酸吗？一般高聚物出现规则helix构象的时候是晶体，去找有关该聚合物晶体结构的文献，里面有坐标及晶胞参数

是聚乳酸的，是不是应该有每一个碳原子的位置坐标才行呐？
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我是萨比，我就是大萨比
4楼2014-05-19 15:37:37
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扶苏不灭

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by pigrass at 2014-05-19 13:51:46
这是一个31-helix的构象，找文献坐标建的





...

太棒了，大神，求问这个的详细做法~~~~
我主要是有几个疑问，这个做法是找到聚乳酸主链上的每一个碳原子的坐标位置，然后确定出来的么？还是利用什么软件直接选用某种螺旋形结构，自动生成的？
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我是萨比，我就是大萨比
5楼2014-05-19 15:41:10
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

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扶苏不灭: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-05-19 17:12:38
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-05-30 19:08:41
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5楼: Originally posted by 扶苏不灭 at 2014-05-19 15:41:10
太棒了，大神，求问这个的详细做法~~~~
我主要是有几个疑问，这个做法是找到聚乳酸主链上的每一个碳原子的坐标位置，然后确定出来的么？还是利用什么软件直接选用某种螺旋形结构，自动生成的？...

我不清楚有没有软件直接生成螺旋链

我是找文献的，里面有C坐标、O坐标，剩余的H原子自动补足就行

具体文献名字忘了
你去找找T Okihara，H Tsuji的文章，这两个人做聚乳酸的
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6楼2014-05-19 16:04:26
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pigrass

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伊卡斯特的小猪
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-30 19:08:47
再推荐一本书
http://muchong.com/html/201107/3412720.html
聚乳酸的综述 估计你会用得上
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7楼2014-05-19 16:27:59
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扶苏不灭

铜虫 (小有名气)
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6楼: Originally posted by pigrass at 2014-05-19 16:04:26
我不清楚有没有软件直接生成螺旋链

我是找文献的，里面有C坐标、O坐标，剩余的H原子自动补足就行

具体文献名字忘了
你去找找T Okihara，H Tsuji的文章，这两个人做聚乳酸的...

那你用的是什么软件，比如说10/3螺旋的构象，那就要求10个聚乳酸分子中的碳氧坐标全部都要知道了是嘛？我只找到了一个聚乳酸分子的碳氧的坐标……我再去找找看。
这个图是你以前画的是么？
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我是萨比，我就是大萨比
8楼2014-05-19 17:08:53
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扶苏不灭

铜虫 (小有名气)
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7楼: Originally posted by pigrass at 2014-05-19 16:27:59
再推荐一本书
http://muchong.com/html/201107/3412720.html
聚乳酸的综述 估计你会用得上

太感谢了，总算是有方向可以循了……
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我是萨比，我就是大萨比
9楼2014-05-19 17:11:59
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pigrass

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8楼: Originally posted by 扶苏不灭 at 2014-05-19 17:08:53
那你用的是什么软件，比如说10/3螺旋的构象，那就要求10个聚乳酸分子中的碳氧坐标全部都要知道了是嘛？我只找到了一个聚乳酸分子的碳氧的坐标……我再去找找看。
这个图是你以前画的是么？...

如果你知道103螺旋各个重复单元在几何上的关系的话，可以由一个乳酸分子推倒出其余分子中C、O原子坐标。具体做法我也不能说太多，因为涉及一个还没结题的基金。给个提示，以螺旋轴为圆心，用柱系坐标写各个原子的坐标比较容易

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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10楼2014-05-19 17:22:56
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