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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 请问如何画 高聚物分子链的螺旋形构象
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扶苏不灭

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by pigrass at 2014-05-19 17:22:56
如果你知道103螺旋各个重复单元在几何上的关系的话，可以由一个乳酸分子推倒出其余分子中C、O原子坐标。具体做法我也不能说太多，因为涉及一个还没结题的基金。给个提示，以螺旋轴为圆心，用柱系坐标写各个原子的坐 ...

柱系坐标……已经超出我的理解了……
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我是萨比，我就是大萨比
11楼2014-05-19 18:04:32
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-30 19:09:01
引用回帖:
11楼: Originally posted by 扶苏不灭 at 2014-05-19 18:04:32
柱系坐标……已经超出我的理解了……...

平面xy用r和theta表示，z还是z

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
12楼2014-05-19 18:10:09
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扶苏不灭

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by pigrass at 2014-05-19 18:10:09
平面xy用r和theta表示，z还是z
...

那就是极坐标是吧，然后算出极坐标，再转换成笛卡尔坐标是么？我找到1990年Hoogsteen写的 crystal structure ，conformation and morphology of solution-spun poly(L-lactide) fibers, 就是只有单个乳酸单元的坐标……您的数据是这篇文献上的么？
或者您看，您画的图源文件还在不在，能不能导出坐标信息来……
如果您能帮忙，真是不胜感激啊
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我是萨比，我就是大萨比
13楼2014-05-19 19:21:16
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-30 19:09:08
引用回帖:
13楼: Originally posted by 扶苏不灭 at 2014-05-19 19:21:16
那就是极坐标是吧，然后算出极坐标，再转换成笛卡尔坐标是么？我找到1990年Hoogsteen写的 crystal structure ，conformation and morphology of solution-spun poly(L-lactide) fibers, 就是只有单个乳酸单元的坐标 ...

是极坐标
我做的不是单一的L或D乳酸晶体，是立体复合物
我刚才试了下那个文献里的31-helix，和我的结构是一致的，应该也是以Z轴为螺旋轴写的坐标，可以试试
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14楼2014-05-19 21:20:39
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扶苏不灭

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by pigrass at 2014-05-19 21:20:39
是极坐标
我做的不是单一的L或D乳酸晶体，是立体复合物
我刚才试了下那个文献里的31-helix，和我的结构是一致的，应该也是以Z轴为螺旋轴写的坐标，可以试试...

好嘞，我去算一下，非常感谢您啦，您是用MS作图的么？
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我是萨比，我就是大萨比
15楼2014-05-20 07:51:27
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扶苏不灭

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by pigrass at 2014-05-19 21:20:39
是极坐标
我做的不是单一的L或D乳酸晶体，是立体复合物
我刚才试了下那个文献里的31-helix，和我的结构是一致的，应该也是以Z轴为螺旋轴写的坐标，可以试试...

另外，你们组在这方面有文章发表么？可不可以推荐几篇文章拜读一下。
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我是萨比，我就是大萨比
16楼2014-05-20 08:13:24
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
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月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-30 19:09:15
引用回帖:
16楼: Originally posted by 扶苏不灭 at 2014-05-20 08:13:24
另外，你们组在这方面有文章发表么？可不可以推荐几篇文章拜读一下。...

我是MS画的
我当时本科论文做的这个
涉及分子模拟的部分我没看到有文章出来
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
17楼2014-05-20 09:05:40
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扶苏不灭

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by pigrass at 2014-05-20 09:05:40
我是MS画的
我当时本科论文做的这个
涉及分子模拟的部分我没看到有文章出来...

您是哪所学校的？本科论文是不收录的是吧……您能告诉一下我您本科论文的题目么？
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我是萨比，我就是大萨比
18楼2014-05-20 10:05:35
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
18楼: Originally posted by 扶苏不灭 at 2014-05-20 10:05:35
您是哪所学校的？本科论文是不收录的是吧……您能告诉一下我您本科论文的题目么？...

题目忘记了 本科论文肯定网上查不到的
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19楼2014-05-20 10:13:08
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雪莲zhrr

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
请问你有聚乳酸α和β晶体结构cif文件了吗？我也在学习聚乳酸MS，现在光找到α晶体结构的10个单元的坐标了，按照文献做还存在问题。
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20楼2019-02-28 05:49:27
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