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sqfn

金虫 (正式写手)

[求助] 求助如何分析gromacs 轨迹中,小分子配基质心与蛋白表面最近的重原子的距离随时间变化 已有1人参与

万能的小木虫,求助各位大神

g_dist能分析小分子配基和蛋白质心之间的距离
g_minidist能分析小分子配基和蛋白上最近原子的之间的距离

不知道小分子配基质心与蛋白表面最近的重原子的距离随时间变化 采用哪个命令,如何设置参数?

谢谢
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sqfn

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fangsteel at 2014-05-16 10:29:03
这个直接写个程度从xtc文件里算应该不麻烦吧

不会呀,大侠写过类似的脚本?
3楼2014-05-16 19:45:17
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sqfn

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fangsteel at 2014-05-16 21:28:31
不是脚本,就是个读xtc的原子坐标数据然后算一下而已,你要是要的话我这边有个读xtc的。h头文件给你...

发我试试看,谢谢啦
5楼2014-05-16 21:32:45
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