| 查看: 800 | 回复: 2 | |||
[求助]
请教，如何总Total energy mapping？
|
|
如题，今天看文章Ab initio calculations of zirconium adsorption and diffusion on graphene，看到了一幅图，文中图5，附件中图1，这幅图是Zr原子在石墨烯上吸附的Total energy mapping，用于表述扩散壁垒（个人理解），文中提到了如何做这幅图，描述如下： In these calculations, we fix the coordinates of two C atoms, away from the absorbed Zr atom, in the graphene surface with the previously calculated and relaxed distances. The two fixed atoms neglect the movement of the graphene center-of-mass during relaxations. We relax all the other C atoms. We nullify the forces of the Zr atom in the x and y axes at every step while the z coordinate is relaxed. The total-energy mapping of the Zr atom on a graphene surface is shown in Fig. 5. 这句话的大概意思是：固定住不靠着被吸附原子的C原子，并且固定Zr的x y坐标，只弛豫z坐标，同时，其余的C原子的所有坐标都弛豫？ 但是这段话还有不明白的地方，请各位前辈指教： 1. The two fixed atoms neglect the movement of the graphene center-of-mass during relaxations. 这句话是什么意思？什么是center-of-mass？？？ 2. 如何实现：固定住不靠着被吸附原子的C原子，并且固定Zr的x y坐标，只弛豫z坐标，同时，其余的C原子的所有坐标都弛豫？使用Dynamic形式的POSCAR吗？ 类似： C 0 0 0 F F T C 0.3 0.3 0 T T T …………… Zr 0.5 0.5 0.1 F F T 这样的一类格式吗？？？ 还是使用什么别的方式做出来？ 3. 最后一个问题，所有能量点的数据计算出来之后，如何用origin作图？？？有些想不出来…… 问题比较难，请各位前辈指教，谢谢   Fig. 1.jpg |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : Ab_initio_calculations_of_zirconium_adsorption_and_diffusion_on_graphene.pdf
2014-05-13 20:56:37, 697.1 K
» 猜你喜欢
本人女孩
已经有10人回复
-
二苯甲酮酸类衍生物
已经有4人回复
-
一志愿中科大材料与化工，353分还有调剂学校吗
已经有11人回复
-
294求调剂
已经有6人回复
-
335求调剂
已经有23人回复
-
279求调剂
已经有13人回复
-
304求调剂
已经有6人回复
-
322求调剂
已经有3人回复
-
271求调剂
已经有39人回复
-
收到复试调剂但是去不了
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教哪里可以做TEM的mapping成像模式？天津及周边地区最好，想测Zn和Cu元素
已经有9人回复
- 向前辈请教：Energy Sources, Part A,这个杂志怎么样？是否提供接受证明？
已经有15人回复
- 请教投过applied energy的同学，投稿系统里没有send email项吗？
已经有9人回复
- 有关energy-dispersive X-ray (EDX) analysis问题的请教
已经有6人回复
- Energy-dispersive X-ray spectroscopy elemental mapping 这个通俗点怎么翻译啊？
已经有3人回复
- 请教碘化铅中碘 3d5/2 binding energy
已经有3人回复
- 请教energy的审稿意见
已经有7人回复
- 新手请教用NEB方法计算energy barrier.
已经有15人回复
- 请教Energy policy 的审稿周期和命中率
已经有13人回复
- 请教 Energy & Environmental Science 的投稿问题
已经有5人回复
- 请教IEEE新增的两个汇刊smart grid, sustainable energy啥时间会被SCI收录啊？
已经有12人回复
- 【请教】EELS mapping还是EDS测试，大家帮忙看看？
已经有6人回复
- 【求助】请教MeshCutOff，PAO.EnergyShift和KgridCutoff等具体物理意义和取值依据
已经有6人回复
shaolin1120
金虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 838.6
- 散金: 18
- 帖子: 60
- 在线: 78.3小时
- 虫号: 2298806
- 注册: 2013-02-25
- 专业: 理论和计算化学
2楼2014-08-04 09:21:53
3楼2014-08-04 21:09:17
20