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米粒儿308

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-05-13 18:00:02
基因够大的,你现在都做了哪几种方法做不出来啊?

其实我一直就觉得是我引物设计的问题,扩出来的片段大于预期的片段
11楼2014-05-15 14:58:46
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-05-16 13:12:03
gyesang: 回帖置顶 2014-05-16 13:12:04
你绕了那么远,还是没说到实验细节上,一个劲的说整不出来,有意义吗?你用什么酶,程序,引物都没交代,我真帮不了你

[ 发自小木虫客户端 ]
12楼2014-05-15 15:06:42
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jimewosen

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
5楼: Originally posted by DavinciTesla at 2014-05-13 18:31:25
体液配方没弄好吧!

什么实验,要用体液

[ 发自小木虫客户端 ]
13楼2014-05-15 15:08:11
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米粒儿308

铁虫 (初入文坛)

gyesang: 回帖置顶 2014-05-16 13:12:17
引用回帖:
12楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-05-15 15:06:42
你绕了那么远,还是没说到实验细节上,一个劲的说整不出来,有意义吗?你用什么酶,程序,引物都没交代,我真帮不了你

额,新手,不太会使用介个,见谅哈~
引物是上游:ctaaacgcgtaccggtcaat
         下游    ttctggcagcttttgtttcc
         模版:拟南芥基因组DNA
         酶:KOD -PLUS-NEO
        程序predenature:94度  2分钟
              denature:     98度  10秒
              annealing:     59度  30秒
             extension:      68度 2分30秒
            30个循环
14楼2014-05-15 15:14:39
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zhangtao0502

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
米粒儿308(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-05-15 16:04:35
你用的酶的极限延伸能力有多大?反应的延伸时间是不是够长。

[ 发自小木虫客户端 ]
15楼2014-05-15 15:16:59
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米粒儿308

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
15楼: Originally posted by zhangtao0502 at 2014-05-15 15:16:59
你用的酶的极限延伸能力有多大?反应的延伸时间是不是够长。

极限好像十几kb,延伸时间是30s/kb,我用3分30秒扩出来的结果和2分30秒扩出来的差不多。。。
16楼2014-05-15 15:19:32
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
14楼: Originally posted by 米粒儿308 at 2014-05-15 15:14:39
额,新手,不太会使用介个,见谅哈~
引物是上游:ctaaacgcgtaccggtcaat
         下游    ttctggcagcttttgtttcc
         模版:拟南芥基因组DNA
         酶:KOD -PLUS-NEO
        程序predenature:94度   ...

你用primer-blast算下,TM是多少,然后找个便宜的mix扩下,退火时间长点,半分钟一分钟都可以的,扩增速度以一分钟一kb算

[ 发自小木虫客户端 ]
17楼2014-05-15 19:54:43
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-05-16 13:12:37
建议:
1.退火温度太高,建议55度。
2.延伸时间太短,建议5-6分钟。
3.以上改进后还不行就重新设计引物。
4.直接从ABRC订购BAC克隆,可以在TAIR上查到,用BAC克隆的质粒做模板肯定可以扩出来。
18楼2014-05-15 21:37:13
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BioChen

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

把你的PCR产物测个序,看看你PCR到底问题出在哪里
19楼2014-05-16 13:32:29
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白话八股

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引物退火温度可能差的太多,或者温度不合适,你去算一下。如果序列不对,延伸温度增加下。还有你的dNTP

[ 发自小木虫客户端 ]
最爱的那个人会出现在身边。
20楼2014-05-16 14:04:58
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