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jurongv

新虫 (初入文坛)

[求助] Exonuclease Ⅲ 可以用来切RNA 得到guanosine 5'-monophosphate吗

老板要我买一个可以用来切RNA得到有鲜味的guanosine 5'-monophosphate的核酸外切酶,我是学纯化学的孩子好么...生物的东西真心不记得了,求各位前辈指教:我现在找到一个Exonuclease Ⅲ (E. coli ),他们网站上的介绍是3'到5'的顺序,但是我不太明白这个顺序切出来是5'的核苷酸吗 (必须要留下5'的才可以,切反了我就完蛋了,花上千块买了没用的药品肯定被骂死...当然老板自己好像也不是很确定,我问他的时候他就叫我查文献make sure,我也没找到文献嘤嘤...)
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

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西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-05-15 21:29:48
引用回帖:
13楼: Originally posted by jurongv at 2014-05-15 21:04:30
这是老板从一个公司那儿弄来的项目啦,玉米发酵过可以提取的东西还有很多,都是有用但是不知道值不值得,除了RNA还有维e多酚什么的,现在我的工作主要就是都弄出来分析一下含量,因为现在GMP确实很便宜,如果含量不是特别 ...

对我们这些只会做点小实验的人,这简直就是另外一个世界。
我今天专门去中国知网看了一下呈味核苷酸生产的文章,酶法制备呈味核苷酸是主流工艺,大多数都是用的桔青霉PDE,但是也有人报道这个酶活性不够,改用RNaseP1的,但是显然后者成本更高。我一直好奇IMP是怎么得到的,原来有酶可以把AMP脱氨转成IMP,于是就没有纯化步骤了,就这样,干燥了就拿去当产品可以卖了。。。
我觉得有一点可能需要考虑的是,我看有些文章也讨论了,就是这样搞的一个前提是,RNA必须是完整的,因为就像现在选酶切成NMP很困难一样,RNA更容易水解的方式产生的是5'羟基,3'磷酸的结构。也就是说,如果你用来纯化的菌要死不活了,RNA已经开始降解了,这些降解产物都是跟NMP相反的结构的。
另外,我看有文章里说,这些企业连桔青霉都是自己养的。
希望你能够改进工艺,这样才能赚钱吧。。。
14楼2014-05-15 21:12:57
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-05-13 08:26:54
jurongv: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-05-13 17:07:59
你这个根本不需要用酶切~~~
RNA用碱水解之后,产生的就是5‘-monophosphate,2‘/3’ hydroxyl 的NMP产物,你只需要再用HPLC之类的方法纯化GMP即可。
据我所知,目前商业化的exonuclease,还没有针对RNA的。
2楼2014-05-12 22:04:15
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biostar2009

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【答案】应助回帖

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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-05-13 08:26:57
你去搞点食品添加剂,呈味核苷酸二钠,那个里面主要就是GMP和IMP,都不用切了,直接分离GMP就好啦?
我觉得GMP应该直接也有卖的!
3楼2014-05-12 22:09:46
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jurongv

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-05-12 22:04:15
你这个根本不需要用酶切~~~
RNA用碱水解之后,产生的就是5‘-monophosphate,2‘/3’ hydroxyl 的NMP产物,你只需要再用HPLC之类的方法纯化GMP即可。
据我所知,目前商业化的exonuclease,还没有针对RNA的。

太谢谢了~可以给具体一点的条件么,我看到碱水解的话不好控制程度啊,会变成核糖\碱基\磷酸这样呢
4楼2014-05-13 17:06:10
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