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紫眸玉儿

木虫 (小有名气)

[求助] RT-PCR 已有7人参与

最近在做RT-PCR,提取完RNA后,电泳时明显三条带,去除DNA后,反转录成CDNA,测其浓度,均达到2ug,而且在260处有最大吸收峰,自我感觉挺好的,就用内参和目的基因的引物跑了PCR,电泳后发现连内参都没有跑出条带,问题处在哪呢?哪位大虾帮解答一下,谢谢!
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BioChen

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-05-11 08:58:36
http://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/
做RT的话,引物最好用文献中报道过的或者primerbank找。
6楼2014-05-10 20:31:11
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+4, 鼓励交流 2014-05-11 08:58:26
1. 提取完RNA后,电泳时明显三条带,说明RNA提取成功
2. 内参也没有跑出条带,说明不是你特异基因引物设计问题

基于以上两点,问题可能出在你的逆转录步骤,逆转录失败了
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2014-05-09 22:50:22
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你怎么测的cDNA浓度?内参引物有没有问题,反转录有没有问题?

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-05-10 07:25:53
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紫眸玉儿

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2014-05-09 22:50:22
1. 提取完RNA后,电泳时明显三条带,说明RNA提取成功
2. 内参也没有跑出条带,说明不是你特异基因引物设计问题

基于以上两点,问题可能出在你的逆转录步骤,逆转录失败了

增加到33个PCR循环数后,内参跑出了,但条带不是很亮,目的基因仍然没有扩增出来。我这是做的半定量PCR,是不是目的基因扩增大小要跟内参片段大小差不多呢?
4楼2014-05-10 10:28:41
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