【答案】应助回帖

4楼: Originally posted by wizardfan at 2014-05-09 19:53:45
1. 找同源的序列： BLAST
2. 生成alignment：clustalx
2.5 （可选） refine alignment： 就是只保留你感兴趣的那部分序列 bioedit
3. 生成进化树： PAUP， MEGA， clustalx 等

8楼: Originally posted by 红卫大兵 at 2014-05-12 12:29:58
你比较一下同源性较高的菌株，看看文章上有没有别人做的进化树，你可以参考人家的做法。

12楼: Originally posted by wangjhsl at 2014-05-14 10:52:52
我还想弱弱的问一下：（可选） refine alignment，这个可选的部分在哪个软件的哪个部分可以完成啊？谢谢...