24小时热门版块排行榜    

查看: 1797  |  回复: 10
当前主题已经存档。

yuerainsea

[交流] 【求助】模拟出来的扩散不正常,怎么办

模拟高分子,小分子后加进去,做了扩散动力学,结果与实验相差数量级,求教高人指教一下。

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-28 at 21:48 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cuihang

铁杆木虫 (正式写手)

VASPer


lei0736(金币+1,VIP+0):愿闻其详
力场的选择很重要,不同的力场计算的扩散结果可以差上千倍
聪明人知道自己是傻子,傻子以为自己是聪明人
2楼2008-03-12 10:08:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuerainsea

我用了compass,看文献都用那个
3楼2008-03-12 17:34:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzgyb

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫警察局局长

优秀版主


lei0736(金币+1,VIP+0):thanks
compass是比较常用,但不怎么使用有机分子
有机分子还是建议使用CVFF,或者PCFF
江南七怪+马玉+洪七公+一灯大师+周伯通教一个弱智儿童=郭靖,天下第一王重阳教七个天资不错的小孩=全真七子,全真七子×3《郭靖,这就是盲目扩招的后果
4楼2008-03-13 17:34:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuerainsea

pcff 没有我的物质的参数,我之前试过他说找不到参数
5楼2008-03-14 10:06:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzgyb

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫警察局局长

优秀版主

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 呵呵 别上火
你计算什么有机分子
怎么会没有参数呢

有机分子就那么多,怎么会没有参数呢
再就是,如果没有,你可以找文献,自己加进去
江南七怪+马玉+洪七公+一灯大师+周伯通教一个弱智儿童=郭靖,天下第一王重阳教七个天资不错的小孩=全真七子,全真七子×3《郭靖,这就是盲目扩招的后果
6楼2008-03-14 10:49:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuerainsea

我觉得,本身盗版软件不够稳定,拿我建盒子来说就总是不稳定,十个建不出5个,有的时候又没问题,
实验文献里没说啊,怎么加参数,
7楼2008-03-17 09:37:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ysjchenmo

木虫 (小有名气)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 鼓励新虫
模拟高分子,小分子后加进去,做了扩散动力学,结果与实验相差数量级
可能不单是力场选择的问题,你模拟的高分子模型与实际高分子之间的差异也可能导致结果与实验相差的数量级。
8楼2008-04-11 13:11:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

saitou

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢
首先力场来说,compass完全可以用于有机分子模拟,这也是Acc公司推荐的力场之一,但是由于过新和强调金属部分的模拟,类型可能不全。我碰到的情况和楼主相反:compass没有的类型只能到pcff里找

第二模拟高分子,我觉得这样的模拟本身就存在很大风险:高分子的规模过大,是不是能很好地选择有代表性的盒子,并将其控制在手头计算机可处理的范围内,是需要摸索的。现在MD的极限也不过是微秒级,所以参考文献的同时,自己不断改进也是很必要的——做不出来好结果也不能光找文献和软件的不是,说不定他也是碰巧了
不抛弃,不放弃
9楼2008-04-11 20:41:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ysjchenmo

木虫 (小有名气)

非常赞同楼上的说法。
10楼2008-04-17 15:42:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yuerainsea 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +4 yuleib84 2026-08-18 5/250 2026-08-18 14:25 by 学员tGYWa5
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +45 医学老男孩 2026-08-13 101/5050 2026-08-18 13:40 by 医学老男孩
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 KZyU1THERRVo 2026-08-18 4/200 2026-08-18 13:28 by vHWVV9D5Deb5
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 8/400 2026-08-18 11:47 by gltch
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +4 Tide man 2026-08-14 5/250 2026-08-18 11:35 by Tide man
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 5/250 2026-08-18 11:25 by 無關想念
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +5 基诺咪客 2026-08-17 6/300 2026-08-18 11:06 by hunter无悔
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
信息提示
请填处理意见