24小时热门版块排行榜    

查看: 2566  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wangshuai_xx

银虫 (初入文坛)

[求助] 关于VMD批量导入的问题 已有1人参与

我用lanmmps做的石墨烯拉伸得结果,
总共dump出来了30000个文件,每个文件里是某一时刻所有252个原子得坐标信息。
现在我想放到VMD里面,看他的动态效果,但是貌似VMD每次只能load1个文件。
有没有批量导入功能啊?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

编程 VMD 可视化软件

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

Es muss sein
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangshuai_xx

银虫 (初入文坛)

我研究了一下,已经知道CatDCD怎么运行的了。看了他的例子,和syntax:
catdcd -o outputfile [-otype <filetype>] [-i indexfile]
      [-stype <filetype>] [-s structurefile]
      [-first firstframe] [-last lastframe] [-stride stride]
      [-<filetype>] inputfile1 [-<filetype>] inputfile2 ...
我现在有600个×.lammpstrj文件。我想把这几个合并然后导入到VMD当中,我在CatDCD文件夹下打开终端 然后输入:
CODE:
./catdcd -o -otype <lammpstrj> all.lammpstrj -first 1 -last 600 -stride 1 60000.lammpstrj 61000.lammpstrj

我的文件是
60000.lammpstrj
61000.lammpstrj
...
660000.lammpstrj
目的是把这些文件合并到 一个文件all.lammpstrj中。
结果失败了,终端显示:bash: lammpstrj: 没有那个文件或目录

请问大婶们,是什么原因呢?
Es muss sein
9楼2014-05-06 22:06:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

smutao

禁虫 (著名写手)

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wangshuai_xx: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-05-06 18:41:05
月只蓝: 金币+1, 感谢指导! 2014-05-16 18:56:38
本帖内容被屏蔽

2楼2014-05-06 18:37:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangshuai_xx

银虫 (初入文坛)

谢谢指点,我搜一下相关命令
Es muss sein
3楼2014-05-06 18:41:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

smutao

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

4楼2014-05-06 18:45:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 4/200 2026-11-07 16:28 by Xc2FxHsHkBNc
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 6/300 2026-11-07 15:44 by Xc2FxHsHkBNc
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 23/1150 2026-11-07 06:49 by Equinoxhua
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 16:43 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 14/700 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 10/500 2026-11-06 12:32 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 12/600 2026-11-06 05:32 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:11 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 04:47 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
信息提示
请填处理意见