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wangshuai_xx

银虫 (初入文坛)

应助: 4 (幼儿园)
金币: 190.9
帖子: 32
在线: 31.3小时
虫号: 1796088
注册: 2012-05-04
性别: GG
专业: 凝聚态物性I:结构、力学和

[求助] 关于VMD批量导入的问题已有1人参与

我用lanmmps做的石墨烯拉伸得结果，
总共dump出来了30000个文件，每个文件里是某一时刻所有252个原子得坐标信息。
现在我想放到VMD里面，看他的动态效果，但是貌似VMD每

次只能load1个文件。
有没有批量导入功能啊？

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VMD 可视化软件

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Es muss sein

1楼2014-05-06 18:26:20

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sbkk

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 1 (幼儿园)
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散金: 45
红花: 4
帖子: 1187
在线: 374.6小时
虫号: 1192095
注册: 2011-01-18
性别: GG
专业: 化学反应工程

在pdb文件同目录下新建read.tcl,输入如下内容

mol new 0.pdb
for {set i 0 } {$i <= 148} {incr i} {
mol addfile output$i.pdb
}

vmd里面打开extension-tk console-load file-read.tcl

调背景，加盒子，display里面自己改喜欢的显示方式

再打开extension-visualion-movie maker设置输出动画条件
注意：需要安装好videomach

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路能走多远，在于事先准备的有多好。不要看到希望而坚持，只有坚持才会看到希望。

14楼2019-04-17 17:56:20

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