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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...

应助: 4 (幼儿园)
贵宾: 0.41
金币: 3521.9
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红花: 8
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在线: 129小时
虫号: 508615
注册: 2008-02-21
性别: MM
专业: 环境污染化学

[交流] [求助]怎样做势能面扫描

要做Scan命令
之前要设置虚原子，完全没有头绪
求高手指教
我qq2150308

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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……

1楼 2008-03-11 18:03:09

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mscic

金虫 (正式写手)

应助: 6 (幼儿园)
金币: 611.2
散金: 150
红花: 5
帖子: 454
在线: 310.3小时
虫号: 443152
注册: 2007-10-27
性别: GG
专业: 结构化学

★ ★
spur(金币+2,VIP+0):感谢应助！欢迎长来！

刚性的扫描是只改变指定坐标，其他分子坐标都不随之变化的扫描

扫描不一定要用ＳＣＡＮ
可以用ＯＰＴ＝ＭＯＤＲＥＤＵＮＤＡＮＴ做，在分子结构后面给出你要扫描的键参数就ＯＫ．

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7楼2008-03-12 17:33:44

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K372

银虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 180.3
帖子: 94
在线: 4.3小时
虫号: 514450
注册: 2008-02-29
性别: GG
专业: 理论和计算化学

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):欢迎常来，谢谢关注

GAUSS的势能面扫描有两种——刚性的和柔性的
刚性的扫描是只改变指定坐标，其他分子坐标都不随之变化的扫描
柔性的扫描是将指定变化的坐标按要求赋值以后，再对其他分子坐标进行优化使之满足一个最小值（相当于通往鞍点的最低脊线）
不同的势能面扫描方案适用于不同要求，不知LZ做势能面扫描是为了何种目的？若是为了研究反应机理和动力学过程，那么应该使用柔性扫描，柔性扫描由于对分子几何构型进行优化，计算代价高昂，需要大量的机时才能完成。

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2楼2008-03-11 18:45:28

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