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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » [求助]怎样做势能面扫描
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...

[交流] [求助]怎样做势能面扫描

要做Scan命令
之前要设置虚原子，完全没有头绪
求高手指教
我qq2150308
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
1楼 2008-03-11 18:03:09
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sandf

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):多谢
这本书上有一个很好的例子：
Exploring Chemistry With Electronic Structure
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努力呀努力，不要成为奴隶。
3楼2008-03-12 08:43:04
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K372

铜虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):欢迎常来，谢谢关注
GAUSS的势能面扫描有两种——刚性的和柔性的
刚性的扫描是只改变指定坐标，其他分子坐标都不随之变化的扫描
柔性的扫描是将指定变化的坐标按要求赋值以后，再对其他分子坐标进行优化使之满足一个最小值（相当于通往鞍点的最低脊线）
不同的势能面扫描方案适用于不同要求，不知LZ做势能面扫描是为了何种目的？若是为了研究反应机理和动力学过程，那么应该使用柔性扫描，柔性扫描由于对分子几何构型进行优化，计算代价高昂，需要大量的机时才能完成。
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2楼2008-03-11 18:45:28
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
书我有，但是看不懂。
不知倒怎样在g view 中怎样把虚原子设置出来。还有怎样定中心轴
我做刚性的，找一个最低势能面
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
4楼2008-03-12 08:48:31
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liliracial

银虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):多谢
虚原子的设定，主要是破坏对称性，比如直线性分子CO，虚原子就该设在中轴线上，保证其二面角。而NH3之类的，就该设在对称中心所在的中轴线上。中心轴的设定，应该先看其对称群，对称群确定后，把虚原子放在中心轴的任何一个位置就可以拉。
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修炼成一块愚钝的大石头
5楼2008-03-12 09:05:25
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