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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

[交流] [求助]怎样做势能面扫描

要做Scan命令
之前要设置虚原子,完全没有头绪
求高手指教
我qq2150308
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
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Roseshu

金虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):多谢
引用回帖:
Originally posted by yyx19840628 at 2008-3-12 08:48:
书我有,但是看不懂。
不知倒怎样在g view 中怎样把虚原子设置出来。还有怎样定中心轴
我做刚性的,找一个最低势能面

在gv中的选择元素的元素周期表上面有个按钮是“X”,这个就表示虚原子。
你可以用两个虚原子,它们形成的直线作为整个分子的中心轴。
如果你对结构输入的要求比较多的话,建议最好点“atom list editor”按钮自己编辑坐标,比直接画了再调整好些。
刚性扫描只要在关键词行加上scan,最后再加上你要扫描的变量的起始值,步长,步数就好了。
6楼2008-03-12 09:34:21
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K372

银虫 (小有名气)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):欢迎常来,谢谢关注
GAUSS的势能面扫描有两种——刚性的和柔性的
刚性的扫描是只改变指定坐标,其他分子坐标都不随之变化的扫描
柔性的扫描是将指定变化的坐标按要求赋值以后,再对其他分子坐标进行优化使之满足一个最小值(相当于通往鞍点的最低脊线)
不同的势能面扫描方案适用于不同要求,不知LZ做势能面扫描是为了何种目的?若是为了研究反应机理和动力学过程,那么应该使用柔性扫描,柔性扫描由于对分子几何构型进行优化,计算代价高昂,需要大量的机时才能完成。
2楼2008-03-11 18:45:28
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sandf

木虫 (正式写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):多谢
这本书上有一个很好的例子:
Exploring Chemistry With Electronic Structure
努力呀努力,不要成为奴隶。
3楼2008-03-12 08:43:04
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

书我有,但是看不懂。
不知倒怎样在g view 中怎样把虚原子设置出来。还有怎样定中心轴
我做刚性的,找一个最低势能面
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
4楼2008-03-12 08:48:31
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