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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 单晶数据明明是挺好的，可就是R值太大，怎么回事？
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

[求助] 单晶数据明明是挺好的，可就是R值太大，怎么回事？ 已有1人参与

单晶数据明明是挺好的，数据的还原度为0.8，Rint Rsigma都是0.02，按理说结构应该一下子就能看出来。可为什么R1 值太高了，把空间群降到p1来解的话，R值依然很高。不知道是怎么回事？求高手指教。
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1楼 2014-05-04 17:45:30
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
calebby: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常感谢，原因我已经弄明白了，是在还原数据的时候选的空间群对称性太高导致的，直接按三斜来还原就OK了。 2014-05-04 22:44:25
你发我帮你看看咋回事。xiao1830@126.com
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以一颗执着不变的心，勇往直前，迎向未来。
2楼2014-05-04 18:21:39
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xja1830 at 2014-05-04 18:21:39
你发我帮你看看咋回事。xiao1830@126.com

Rint Rsigma都是0.02，I/Sigma为6点多，数据的还原度为0.8，按理说数据应该是非常好了，但就是R值太多。一个很可能的原因就是空间群选错了，我试图把空间群降到p1来解，然后再升上去，但结果R值还是非常大。希望您能帮我分析一下，非常感谢。
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3楼2014-05-04 18:44:21
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)
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2楼: Originally posted by xja1830 at 2014-05-04 18:21:39
你发我帮你看看咋回事。xiao1830@126.com

数据已经都发到您的邮箱了，真的是非常感谢。
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4楼2014-05-04 18:45:06
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我看了下数据，找到了原因。其实你这个数据并不好！首先信噪比比较差。但这不是决定晶体能不能解出的主要原因。关键是，你的数据完整度太差，只有65%！！！这样的数据怎么能解出来啊！按发表的要求，至少要》95%。少于95%的部分都要用分辨率截断的。建议收集数据的时候收集角度尽量大些，及时高角度数据用不着也可以截断的，但是收集角度不够就只能重测了。
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5楼2014-05-04 19:21:27
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calebby

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5楼: Originally posted by xja1830 at 2014-05-04 19:21:27
我看了下数据，找到了原因。其实你这个数据并不好！首先信噪比比较差。但这不是决定晶体能不能解出的主要原因。关键是，你的数据完整度太差，只有65%！！！这样的数据怎么能解出来啊！按发表的要求，至少要》95%。少 ...

非常感谢您的回答。看来有一些地方我一直弄错了。信噪比不是I/Sigma吗？如果不是，那应该在什么地方看呢？数据的完整度是在哪看呢？我的单晶仪是Bruker的，解晶体用的软件是SHELTXL。
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6楼2014-05-04 19:32:01
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xja1830

木虫 (正式写手)
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6楼: Originally posted by calebby at 2014-05-04 19:32:01
非常感谢您的回答。看来有一些地方我一直弄错了。信噪比不是I/Sigma吗？如果不是，那应该在什么地方看呢？数据的完整度是在哪看呢？我的单晶仪是Bruker的，解晶体用的软件是SHELTXL。...

对，进入xprep首先看到的就是信噪比，一般最后大于15，但也不是说大于15就一定能解出。很多数据小于10也可以交容易的解析。所以数据是一定要很多因素综合评价的。
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7楼2014-05-04 19:34:39
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

数据完整度是在空间群确定之后保存初始ins值钱出现一个列表，一般数据还原老师会帮你进行分表率截断，就是根据数据完整度来判断截断点的。一般95%一下都最后不要，会影响Rint和Rsigma值。如果数据的最高分辨率就是65%，想一下差的数据岂不更烂？
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8楼2014-05-04 19:39:25
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calebby

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8楼: Originally posted by xja1830 at 2014-05-04 19:39:25
数据完整度是在空间群确定之后保存初始ins值钱出现一个列表，一般数据还原老师会帮你进行分表率截断，就是根据数据完整度来判断截断点的。一般95%一下都最后不要，会影响Rint和Rsigma值。如果数据的最高分辨率就是6 ...

非常感谢您的回复，现在我还有一个疑问，请赐教：晶体数据的还原度低一般有两种可能：一是晶体本身的质量差，导致衍射点差点；二是空间群选错了。我的这颗晶体已经长得挺大的，而且在单晶仪上的衍射点也非常好，所以应该不能是第一种情况。那究竟要怎么判断是否是空间群选错引起的呢？空间群降到p1还是解不出来。
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9楼2014-05-04 20:51:54
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xja1830

木虫 (正式写手)
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9楼: Originally posted by calebby at 2014-05-04 20:51:54
非常感谢您的回复，现在我还有一个疑问，请赐教：晶体数据的还原度低一般有两种可能：一是晶体本身的质量差，导致衍射点差点；二是空间群选错了。我的这颗晶体已经长得挺大的，而且在单晶仪上的衍射点也非常好，所 ...

按说，应该不是晶体质量问题，空间群选错是可以再重头来重选的，可能是数据收集策略问题吧！
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10楼2014-05-04 21:34:07
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