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calebby

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[求助] 单晶数据明明是挺好的,可就是R值太大,怎么回事? 已有1人参与

单晶数据明明是挺好的,数据的还原度为0.8,Rint Rsigma都是0.02,按理说结构应该一下子就能看出来。可为什么R1 值太高了,把空间群降到p1来解的话,R值依然很高。不知道是怎么回事?求高手指教。
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
calebby: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常感谢,原因我已经弄明白了,是在还原数据的时候选的空间群对称性太高导致的,直接按三斜来还原就OK了。 2014-05-04 22:44:25
你发我帮你看看咋回事。xiao1830@126.com
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
2楼2014-05-04 18:21:39
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xja1830 at 2014-05-04 18:21:39
你发我帮你看看咋回事。xiao1830@126.com

Rint Rsigma都是0.02,I/Sigma为6点多,数据的还原度为0.8,按理说数据应该是非常好了,但就是R值太多。一个很可能的原因就是空间群选错了,我试图把空间群降到p1来解,然后再升上去,但结果R值还是非常大。希望您能帮我分析一下,非常感谢。
3楼2014-05-04 18:44:21
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xja1830 at 2014-05-04 18:21:39
你发我帮你看看咋回事。xiao1830@126.com

数据已经都发到您的邮箱了,真的是非常感谢。
4楼2014-05-04 18:45:06
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我看了下数据,找到了原因。其实你这个数据并不好!首先信噪比比较差。但这不是决定晶体能不能解出的主要原因。关键是,你的数据完整度太差,只有65%!!!这样的数据怎么能解出来啊!按发表的要求,至少要》95%。少于95%的部分都要用分辨率截断的。建议收集数据的时候收集角度尽量大些,及时高角度数据用不着也可以截断的,但是收集角度不够就只能重测了。
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
5楼2014-05-04 19:21:27
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xja1830 at 2014-05-04 19:21:27
我看了下数据,找到了原因。其实你这个数据并不好!首先信噪比比较差。但这不是决定晶体能不能解出的主要原因。关键是,你的数据完整度太差,只有65%!!!这样的数据怎么能解出来啊!按发表的要求,至少要》95%。少 ...

非常感谢您的回答。看来有一些地方我一直弄错了。信噪比不是I/Sigma吗?如果不是,那应该在什么地方看呢?数据的完整度是在哪看呢?我的单晶仪是Bruker的,解晶体用的软件是SHELTXL。
6楼2014-05-04 19:32:01
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xja1830

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by calebby at 2014-05-04 19:32:01
非常感谢您的回答。看来有一些地方我一直弄错了。信噪比不是I/Sigma吗?如果不是,那应该在什么地方看呢?数据的完整度是在哪看呢?我的单晶仪是Bruker的,解晶体用的软件是SHELTXL。...

对,进入xprep首先看到的就是信噪比,一般最后大于15,但也不是说大于15就一定能解出。很多数据小于10也可以交容易的解析。所以数据是一定要很多因素综合评价的。
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
7楼2014-05-04 19:34:39
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

数据完整度是在空间群确定之后保存初始ins值钱出现一个列表,一般数据还原老师会帮你进行分表率截断,就是根据数据完整度来判断截断点的。一般95%一下都最后不要,会影响Rint和Rsigma值。如果数据的最高分辨率就是65%,想一下差的数据岂不更烂?
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
8楼2014-05-04 19:39:25
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calebby

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引用回帖:
8楼: Originally posted by xja1830 at 2014-05-04 19:39:25
数据完整度是在空间群确定之后保存初始ins值钱出现一个列表,一般数据还原老师会帮你进行分表率截断,就是根据数据完整度来判断截断点的。一般95%一下都最后不要,会影响Rint和Rsigma值。如果数据的最高分辨率就是6 ...

非常感谢您的回复,现在我还有一个疑问,请赐教:晶体数据的还原度低一般有两种可能:一是晶体本身的质量差,导致衍射点差点;二是空间群选错了。我的这颗晶体已经长得挺大的,而且在单晶仪上的衍射点也非常好,所以应该不能是第一种情况。那究竟要怎么判断是否是空间群选错引起的呢?空间群降到p1还是解不出来。
9楼2014-05-04 20:51:54
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xja1830

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by calebby at 2014-05-04 20:51:54
非常感谢您的回复,现在我还有一个疑问,请赐教:晶体数据的还原度低一般有两种可能:一是晶体本身的质量差,导致衍射点差点;二是空间群选错了。我的这颗晶体已经长得挺大的,而且在单晶仪上的衍射点也非常好,所 ...

按说,应该不是晶体质量问题,空间群选错是可以再重头来重选的,可能是数据收集策略问题吧!
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
10楼2014-05-04 21:34:07
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