| 查看: 669 | 回复: 0 | |||
136zhangpong新虫 (小有名气)
|
[求助]
关于运行MMPBSA/GBSA的Decomposition时设置&gb的介电常数问题
|
| 本人最近在用MMPBSA/GBSA的Decomposition时，想改变外部溶剂的介电常数，gb和pb都改；在gb中外部溶剂的介电常数用的参数为extdiel=4,内部溶质的介电常数用的参数为intdiel=1.0,在pb中外部溶剂中的介电常数用的参数为exdi=4,内部溶质的介电常数用的参数为indi=1.0；运行后总是报错：Unrecognized variable (extdiel) in namelist (gb)! Unrecognized variable (intdiel) in namelist (gb)! ；之后我不在&gb里面设置，只在&pb里面设置，发现没有问题了，但只有pb算出来的才和普通的（没有改变过介电常数的MMPBSA计算结果）有变化；gb和普通的结果一样，因为没有设置介电常数；现在我想知道这个gb里的介电常数该怎么设才不会出问题；这个参数我都是在教程里找的，pb的没有报错，gb的报错了。 |
回复此楼» 猜你喜欢
有没有人能给点建议
已经有5人回复
-
假如你的研究生提出不合理要求
已经有12人回复
-
实验室接单子
已经有7人回复
-
全日制（定向）博士
已经有5人回复
-
萌生出自己或许不适合搞科研的想法，现在跑or等等看？
已经有4人回复
-
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有4人回复
-
参与限项
已经有3人回复
-
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
-
所感
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有7人回复