| 查看: 758 | 回复: 0 | ||
136zhangpong新虫 (小有名气)
|
[求助]
关于运行MMPBSA/GBSA的Decomposition时设置&gb的介电常数问题
|
| 本人最近在用MMPBSA/GBSA的Decomposition时，想改变外部溶剂的介电常数，gb和pb都改；在gb中外部溶剂的介电常数用的参数为extdiel=4,内部溶质的介电常数用的参数为intdiel=1.0,在pb中外部溶剂中的介电常数用的参数为exdi=4,内部溶质的介电常数用的参数为indi=1.0；运行后总是报错：Unrecognized variable (extdiel) in namelist (gb)! Unrecognized variable (intdiel) in namelist (gb)! ；之后我不在&gb里面设置，只在&pb里面设置，发现没有问题了，但只有pb算出来的才和普通的（没有改变过介电常数的MMPBSA计算结果）有变化；gb和普通的结果一样，因为没有设置介电常数；现在我想知道这个gb里的介电常数该怎么设才不会出问题；这个参数我都是在教程里找的，pb的没有报错，gb的报错了。 |
回复此楼» 猜你喜欢
各位大神，目前国内有哪些比较好用的逆合成软件？
已经有13人回复
-
国社科系统bug了，是不是要放榜了？
已经有10人回复
-
现代”学阀”该如何界定
已经有9人回复
-
课题组招2027级博士 上海工程技术大学 激光智能制造方向
已经有4人回复
-
上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生
已经有3人回复
-
上海工程技术大学激光智能制造课题组｜2027级博士研究生招生公告
已经有11人回复
-
上海工程技术大学激光智能制造课题组-博士研究生
已经有10人回复
-
申博发邮件
已经有11人回复
-
我的奶奶
已经有3人回复