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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 对于分子数较多的周期性结构的优化问题
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小虫_sang

铁虫 (正式写手)

[求助] 对于分子数较多的周期性结构的优化问题 已有2人参与

对一个一维无限长纳米管结构进行优化，由于周期内结构原子数目庞大（336个原子），我的思路是：先用Forcite中的力场进行几何优化，然后再用Dmol3优化，有两个问题请教一下各位大神：
1、用Forcite力场优化时是不是只选择一个合适的力场然后“Geometry Optimization”就行了，不需要跑动力学吧？
2、在用Dmol3优化前是不是需要用Forcite优化好的结构中的力场退掉？还有怎么退力场？不退力场的话在接下来的优化中会有什么影响吗？
先谢谢了，，，非常感谢指点
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1楼 2014-04-29 11:52:04
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Joannaouc

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 鼓励交流。。 2014-05-05 23:00:34
1. 没用过forcite，但是应该只做OPT就可以
2.dmol不会读去forcite的立力场，会用DFT的方法重新进行优化。所以这个问题不存在，把上一个结构读过来就行了。
还有个问题是你准备怎么优化晶格常数呢，还是就用实验值？
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3楼2014-05-01 10:50:18
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-05-05 22:59:25
先用DFT-B模块优化吧，然后把优化的最后结果保存下来再读入用dmol优化
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
2楼2014-04-30 16:30:18
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小虫_sang

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2014-04-30 16:30:18
先用DFT-B模块优化吧，然后把优化的最后结果保存下来再读入用dmol优化

新手弱弱的问一句：“DFT—B”是什么模块？这个模块式用力场优化的还是量化计算的？
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4楼2014-05-01 21:05:28
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小虫_sang

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Joannaouc at 2014-05-01 10:50:18
1. 没用过forcite，但是应该只做OPT就可以
2.dmol不会读去forcite的立力场，会用DFT的方法重新进行优化。所以这个问题不存在，把上一个结构读过来就行了。
还有个问题是你准备怎么优化晶格常数呢，还是就用实验值 ...

因为我的结构是个孤立的管，所以在a、b方向上是加真空的，所以我只优化C方向的晶格
也就是说forcite优化后的结构不用退掉力场直接用Dmol优化就行是吧？但是Dmol优化时能量震荡的厉害，是结构不太合理吗？刚开始我还以为是没有退掉力场的原因呢，，，望指教
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5楼2014-05-01 21:09:49
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