24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3092  |  回复: 37
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

板桥霜

木虫 (正式写手)

[求助] 求助--Openmpi-1.8集群编译问题 已有2人参与

各位大侠,本人纯属菜鸟,最近出于好奇,爱好,兴趣。。。。。搞了几台台古董,想自己搭建集群,怎奈基础不牢,从开始到现在快两个周了,还没有成功,废话不多说,上问题,忘各位不吝赐教。
硬件环境:1台浪潮服务器:2个CPU,两核,Intel Xeon 2.4GHz. 2台并行机,1个CPU,Pentium D 3.4GHz,1000M交换机。
软件:redhat linux 6.2,Intel l_fcompcxe_2013_sp1.2.144 & l_ccompcxe_3013_sp1.2.144, Openmpi-1.8,目标是并行编译安装vasp5.2,实现并行运算。
目前进行到单机并行编译VASP,运算没有问题,但是无法实现集群并行运算。我感觉问题出现在Openmpi上,经过我自己的测试,编译Openmpi用以下指令:
./configure --prefix=/usr/local/openmpi-1.8 FC=/opt/intel/bin/ifort CC=/opt/intel/bin/icc CXX=/opt/intel/bin/cipc
make
make install
后测试运行hello_c
结果:
hello, world, I am 0 of 2,.....
hello, world, I am 1 of 2,....
如果修改openmpi-default-hostfile添加各节点;
LAB-P1 slots=1
LAB-P2 slots=2
运行测试
mpirun hello_c
得到结果如下:
bash: orted: command not found
bash: orted: command not found
请问各位大侠,是我的openmpi 没有编译对吗?如果是,问题出在哪?我该怎么做?如果不是又该怎么处理呢?
谢谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

板桥霜

木虫 (正式写手)

问题解决了,感谢各位老大,现在并行到12核,但是到14核就出现问题了,估计是系统或者mpi,或者vasp哪儿有限制核数。。。。。。。
36楼2014-10-09 11:16:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 38 个回答

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
问一句,你的两台机器做了共享NFS服务否,还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home ... g&id=159741
2楼2014-04-27 20:48:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

板桥霜

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 20:48:58
问一句,你的两台机器做了共享NFS服务否,还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home.php?mod=space&uid=1556291&do=blog&id=159741...

作了共享了,我先学习下

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-04-27 21:49:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

板桥霜

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 20:48:58
问一句,你的两台机器做了共享NFS服务否,还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home.php?mod=space&uid=1556291&do=blog&id=159741...

大侠,你是用的mpi﹉

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-04-27 21:55:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然面上和省基金B类撒花 +17 花田半亩~白 2026-04-21 17/850 2026-04-23 07:30 by john198197
[考博] 华师大读博 +3 xq83 2026-04-22 5/250 2026-04-22 10:42 by xq83
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +5 yexuqing 2026-04-19 5/250 2026-04-22 10:01 by easeheart
[论文投稿] 急需审稿人!!! +3 陆小果画大饼 2026-04-21 3/150 2026-04-21 23:54 by jzy_123456
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
信息提示
请填处理意见