24小时热门版块排行榜    

查看: 1843  |  回复: 9

绍敏郡主

木虫 (著名写手)

[交流] 请问从1万个同分异构体中海选出能量最低的应该怎么操作啊

谢谢。
现在只有分子的坐标。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fooo

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
绍敏郡主: 金币+10 2014-04-27 09:24:11
gmy1990: 金币+2 2014-04-27 17:46:05
可以先用分子力学或半经验算法进行构象搜索,这样可以筛除绝大多数构象,然后找用高等级的算法进行构象优化,应该就差不多了。
2楼2014-04-27 03:24:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jinwei331

至尊木虫 (文坛精英)

?…………………………/
3楼2014-04-27 06:17:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
4楼2014-04-27 08:22:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

绍敏郡主

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fooo at 2014-04-27 03:24:31
可以先用分子力学或半经验算法进行构象搜索,这样可以筛除绝大多数构象,然后找用高等级的算法进行构象优化,应该就差不多了。

谢谢。
文件数量巨大,不知道具体应该怎么操作?
现在有很多坐标文件,把坐标一个一个输入就太麻烦了。
能自动进行计算吗?
5楼2014-04-27 09:23:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我的小名

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
绍敏郡主: 金币+10 2014-04-27 16:56:30
手工输入显然是不行的。楼主若是熟悉linux的话,可以尝试awk,sed等编辑器,写一个脚本做出各个输入文件。再写个bash的脚本自动搜索输入文件进行计算。
还请楼主详述,或许可以帮到你。
ElCondorPasa
6楼2014-04-27 16:32:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

绍敏郡主

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 我的小名 at 2014-04-27 16:32:09
手工输入显然是不行的。楼主若是熟悉linux的话,可以尝试awk,sed等编辑器,写一个脚本做出各个输入文件。再写个bash的脚本自动搜索输入文件进行计算。
还请楼主详述,或许可以帮到你。

非常感谢,以后算的话再向你咨询
7楼2014-04-27 16:59:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chiweijie

禁虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
绍敏郡主: 金币+10, 谢谢 2014-04-27 17:09:37
本帖内容被屏蔽

8楼2014-04-27 17:05:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
9楼2014-04-27 17:42:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
10楼2014-04-27 17:59:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 绍敏郡主 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 让我中一个面上吧! +8 大萍1987 2026-08-20 10/500 2026-08-20 21:48 by 大萍1987
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 22/1100 2026-08-20 17:03 by yaoyewhu2008
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见