24小时热门版块排行榜    

查看: 3283  |  回复: 7

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 用Dmol3 LST/QST 计算过渡态的高手进来! 已有1人参与

各位前辈,大家好:
我初学 Dmol3 LST/QST计算过渡态,有好多不懂的地方。首先,在过渡态搜索完成后,会出现一个为TS.outmol 的文件,可以从里面找到能量势垒和反应能量,为了快速找到,可以按下CTRL+F来搜索,但我不知道搜索的时候该键入什么,也就是说不知道这两个能量用哪些字母表示。还有就是出现的所有的负的频率值都是虚频吗?好像是最大的一个负频率保留,其他的小得都要消去。消去的一个简单方法,可以用TS optimization,来消除,那具体操作步骤是怎样的?希望前辈们帮帮我,感激不尽!
回复此楼
好好研究,天天向上!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-04-27 09:53:36
小小鑫000: 金币+5 2014-04-27 11:46:16
你可以去看看下面具体说明,有图片有例子,我想会对你有帮助的。

http://www.docin.com/p-340740633.html

http://wenku.baidu.com/view/b7ae37a3284ac850ad02426e.html
2楼2014-04-26 23:52:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-26 23:52:22
你可以去看看下面具体说明,有图片有例子,我想会对你有帮助的。

http://www.docin.com/p-340740633.html

http://wenku.baidu.com/view/b7ae37a3284ac850ad02426e.html

前辈,谢谢你的帮助。看官网上说用vasp 算bader charge 时需要4.6.31以上版本,那我的vasp 版本是4.6.28的,那就意味着不能算了吧,还是说安装个什么程序就能算了那?
好好研究,天天向上!
3楼2014-04-28 18:17:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-04-28 18:17:41
前辈,谢谢你的帮助。看官网上说用vasp 算bader charge 时需要4.6.31以上版本,那我的vasp 版本是4.6.28的,那就意味着不能算了吧,还是说安装个什么程序就能算了那?...

你下载一个5.2以上的vasp吧,论坛上就有.
4楼2014-04-28 18:39:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 18:39:05
你下载一个5.2以上的vasp吧,论坛上就有....

前辈,我们实验室的服务器只能装4.6.28的,我只能换别的算法了,你知不知道Hartree电荷布局分析呀,有没有这方面的资料?谢谢了!
好好研究,天天向上!
5楼2014-04-28 20:44:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-05-05 22:32:00
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-04-28 20:44:00
前辈,我们实验室的服务器只能装4.6.28的,我只能换别的算法了,你知不知道Hartree电荷布局分析呀,有没有这方面的资料?谢谢了!...

这是不可能的,只能装4.6.28
既然能装4.6.28,说明所有的库函数都是全,那就不会有这个局限性
6楼2014-04-28 21:48:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 21:48:18
这是不可能的,只能装4.6.28
既然能装4.6.28,说明所有的库函数都是全,那就不会有这个局限性...

真是这样的,前辈,安装这个的工程师说只能装这个版本
好好研究,天天向上!
7楼2014-04-28 23:19:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
7楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-04-28 23:19:55
真是这样的,前辈,安装这个的工程师说只能装这个版本...

哎,我自己管理一个大集群。不是出现这样的事情,就算现在的库不能安装,可以自己再更新库函数也能够安装。没有做不到,只有不想做。
8楼2014-04-28 23:22:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小小鑫000 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 h4CP7TrQR8Lg 2026-08-22 3/150 2026-08-23 16:30 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 15:33 by KM5EcsNQRBPn
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 4/200 2026-08-23 15:30 by KM5EcsNQRBPn
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 14:57 by KM5EcsNQRBPn
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +3 process2012 2026-08-23 4/200 2026-08-23 12:54 by huixian257
[基金申请] 让我中一个面上吧! +12 大萍1987 2026-08-20 14/700 2026-08-23 10:30 by wrm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 07:41 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见