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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 用Dmol3 LST/QST 计算过渡态的高手进来！
汕头大学海洋科学接受调剂
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 用Dmol3 LST/QST 计算过渡态的高手进来！ 已有1人参与

各位前辈，大家好：
我初学 Dmol3 LST/QST计算过渡态，有好多不懂的地方。首先，在过渡态搜索完成后，会出现一个为TS.outmol 的文件，可以从里面找到能量势垒和反应能量，为了快速找到，可以按下CTRL+F来搜索，但我不知道搜索的时候该键入什么，也就是说不知道这两个能量用哪些字母表示。还有就是出现的所有的负的频率值都是虚频吗？好像是最大的一个负频率保留，其他的小得都要消去。消去的一个简单方法，可以用TS optimization，来消除，那具体操作步骤是怎样的？希望前辈们帮帮我，感激不尽！
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好好研究，天天向上！
1楼 2014-04-26 18:18:11
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-04-27 09:53:36
小小鑫000: 金币+5 2014-04-27 11:46:16
你可以去看看下面具体说明，有图片有例子，我想会对你有帮助的。

http://www.docin.com/p-340740633.html

http://wenku.baidu.com/view/b7ae37a3284ac850ad02426e.html
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2楼2014-04-26 23:52:22
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-26 23:52:22
你可以去看看下面具体说明，有图片有例子，我想会对你有帮助的。

http://www.docin.com/p-340740633.html

http://wenku.baidu.com/view/b7ae37a3284ac850ad02426e.html

前辈，谢谢你的帮助。看官网上说用vasp 算bader charge 时需要4.6.31以上版本，那我的vasp 版本是4.6.28的，那就意味着不能算了吧，还是说安装个什么程序就能算了那？
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3楼2014-04-28 18:17:41
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-04-28 18:17:41
前辈，谢谢你的帮助。看官网上说用vasp 算bader charge 时需要4.6.31以上版本，那我的vasp 版本是4.6.28的，那就意味着不能算了吧，还是说安装个什么程序就能算了那？...

你下载一个5.2以上的vasp吧，论坛上就有.
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4楼2014-04-28 18:39:05
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 18:39:05
你下载一个5.2以上的vasp吧，论坛上就有....

前辈，我们实验室的服务器只能装4.6.28的，我只能换别的算法了，你知不知道Hartree电荷布局分析呀，有没有这方面的资料？谢谢了！
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好好研究，天天向上！
5楼2014-04-28 20:44:00
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-05-05 22:32:00
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-04-28 20:44:00
前辈，我们实验室的服务器只能装4.6.28的，我只能换别的算法了，你知不知道Hartree电荷布局分析呀，有没有这方面的资料？谢谢了！...

这是不可能的，只能装4.6.28
既然能装4.6.28，说明所有的库函数都是全，那就不会有这个局限性
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6楼2014-04-28 21:48:18
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 21:48:18
这是不可能的，只能装4.6.28
既然能装4.6.28，说明所有的库函数都是全，那就不会有这个局限性...

真是这样的，前辈，安装这个的工程师说只能装这个版本
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7楼2014-04-28 23:19:55
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-04-28 23:19:55
真是这样的，前辈，安装这个的工程师说只能装这个版本...

哎，我自己管理一个大集群。不是出现这样的事情，就算现在的库不能安装，可以自己再更新库函数也能够安装。没有做不到，只有不想做。
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8楼2014-04-28 23:22:28
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