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汕头大学海洋科学接受调剂
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 用Dmol3 LST/QST 计算过渡态的高手进来! 已有1人参与

各位前辈,大家好:
我初学 Dmol3 LST/QST计算过渡态,有好多不懂的地方。首先,在过渡态搜索完成后,会出现一个为TS.outmol 的文件,可以从里面找到能量势垒和反应能量,为了快速找到,可以按下CTRL+F来搜索,但我不知道搜索的时候该键入什么,也就是说不知道这两个能量用哪些字母表示。还有就是出现的所有的负的频率值都是虚频吗?好像是最大的一个负频率保留,其他的小得都要消去。消去的一个简单方法,可以用TS optimization,来消除,那具体操作步骤是怎样的?希望前辈们帮帮我,感激不尽!
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好好研究,天天向上!
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-04-27 09:53:36
小小鑫000: 金币+5 2014-04-27 11:46:16
你可以去看看下面具体说明,有图片有例子,我想会对你有帮助的。

http://www.docin.com/p-340740633.html

http://wenku.baidu.com/view/b7ae37a3284ac850ad02426e.html
2楼2014-04-26 23:52:22
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-26 23:52:22
你可以去看看下面具体说明,有图片有例子,我想会对你有帮助的。

http://www.docin.com/p-340740633.html

http://wenku.baidu.com/view/b7ae37a3284ac850ad02426e.html

前辈,谢谢你的帮助。看官网上说用vasp 算bader charge 时需要4.6.31以上版本,那我的vasp 版本是4.6.28的,那就意味着不能算了吧,还是说安装个什么程序就能算了那?
好好研究,天天向上!
3楼2014-04-28 18:17:41
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-04-28 18:17:41
前辈,谢谢你的帮助。看官网上说用vasp 算bader charge 时需要4.6.31以上版本,那我的vasp 版本是4.6.28的,那就意味着不能算了吧,还是说安装个什么程序就能算了那?...

你下载一个5.2以上的vasp吧,论坛上就有.
4楼2014-04-28 18:39:05
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 18:39:05
你下载一个5.2以上的vasp吧,论坛上就有....

前辈,我们实验室的服务器只能装4.6.28的,我只能换别的算法了,你知不知道Hartree电荷布局分析呀,有没有这方面的资料?谢谢了!
好好研究,天天向上!
5楼2014-04-28 20:44:00
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-05-05 22:32:00
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-04-28 20:44:00
前辈,我们实验室的服务器只能装4.6.28的,我只能换别的算法了,你知不知道Hartree电荷布局分析呀,有没有这方面的资料?谢谢了!...

这是不可能的,只能装4.6.28
既然能装4.6.28,说明所有的库函数都是全,那就不会有这个局限性
6楼2014-04-28 21:48:18
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 21:48:18
这是不可能的,只能装4.6.28
既然能装4.6.28,说明所有的库函数都是全,那就不会有这个局限性...

真是这样的,前辈,安装这个的工程师说只能装这个版本
好好研究,天天向上!
7楼2014-04-28 23:19:55
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
7楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-04-28 23:19:55
真是这样的,前辈,安装这个的工程师说只能装这个版本...

哎,我自己管理一个大集群。不是出现这样的事情,就算现在的库不能安装,可以自己再更新库函数也能够安装。没有做不到,只有不想做。
8楼2014-04-28 23:22:28
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