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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » Surflex-dock出错，软件版本sybyl-x2.0
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新虫 (小有名气)

[求助] Surflex-dock出错，软件版本sybyl-x2.0 已有2人参与

分子对接完后，在等待Dockingrun的过程中，出现Unable to find necessary files是怎么回事？急求大神指教
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1楼 2014-04-23 15:19:25
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-16 19:55:12
不知道你哪一步出错了，建议看一下http://www.tri-ibiotech.com.cn/Video/
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2楼2014-05-04 16:00:19
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新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wbingxin2012 at 2014-05-04 16:00:19
不知道你哪一步出错了，建议看一下http://www.tri-ibiotech.com.cn/Video/

我用sybyl画的不行…后面用chemdraw画的导入sybyl就能做了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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3楼2014-05-07 13:26:51
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-16 19:55:21
引用回帖:
3楼: Originally posted by Galleries at 2014-05-07 13:26:51
我用sybyl画的不行…后面用chemdraw画的导入sybyl就能做了
...

不在于你用什么画，你是对接的时候缺少必要文件
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4楼2014-05-07 14:27:21
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新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wbingxin2012 at 2014-05-07 14:27:21
不在于你用什么画，你是对接的时候缺少必要文件...

嗯…但是筛查起来很麻烦,我用的其他办法了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼2014-05-13 17:55:35
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windf1ower

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Galleries: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2014-05-15 00:42:47
月只蓝: 金币+3, 鼓励交流 2014-05-16 19:55:27
我不确定lz说的问题是不是我曾经遇到过的，sybyl画完小分子之后记得随意选中一个原子，然后edit➡️molecule➡️name命个名，不然molecular area那里显示的是no name，对接完就会报错。但是其实在application➡️docking suite➡️analyze result里打开你jobname的文件夹是可以正常查看结果的
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问题咨询请邮件联系zhouqing_gzu@sina.com
6楼2014-05-14 22:04:29
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新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by windf1ower at 2014-05-14 22:04:29
我不确定lz说的问题是不是我曾经遇到过的，sybyl画完小分子之后记得随意选中一个原子，然后edit➡️molecule➡️name命个名，不然molecular area那里显示的是no name，对接完就会报错。但是 ...

对对对…我遇到的就是这样的情况,握爪丫

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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7楼2014-05-15 00:41:30
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Mr_Hor

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
8楼2018-11-24 09:54:48
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