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yylcx

金虫 (正式写手)

[求助] 怎样得到一个芳香基团所在平面的法向量 已有1人参与

各位前辈,我在模拟时需要知道一个分子的定向,这个分子含有一个苯环,请问怎样能得到这个苯环所在平面的法向量呢?我们用的是NAMD。多谢多谢
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yylcx

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2014-04-23 23:10:45
根据苯环上三个原子确定, 利用叉乘

这样啊,好的呢,我之前看文献还以为可以通过什么脚本得到。多谢多谢,这也是一个很好的办法
3楼2014-04-24 08:38:41
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yylcx: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-24 08:39:29
月只蓝: 金币+1, 感谢指导! 2014-04-24 18:18:51
根据苯环上三个原子确定, 利用叉乘
2楼2014-04-23 23:10:45
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