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新手求助一个quantum-espresso的使用问题！ 已有1人参与
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我编写了一个Grephene结构优化的代码，quantum-espresso运行的时候没有提示错误，程序一直在运行但也没有任何输出，代码如下所示： &CONTROL calculation =’relax’, restart_mode=’from_scratch’, pseudo_dir = "/usr/share/espresso/pseudo", outdir = "/home/wangdb/Workspaces/QE/graphene", / &SYSTEM ibrav = 4, celldm(1) = 4.64117D0, celldm(3) = 12.2149837D0, nat = 2, ntyp = 1, ecutwfc = 60, occupations = "smearing", smearing = ’fermi-dirac’, degauss = 0.02, / &ELECTRONS conv_thr = 1.D-8, mixing_beta = 0.3D0, / &IONS ion_dynamics = "bfgs", pot_extrapolation = "atomic", / ATOMIC_SPECIES C 12.0107 C.pbe-van_bm.UPF ATOMIC_POSITIONS C 0.0000000 0.0000000 0.000000 C 0.0000000 0.67735027 0.000000 K_POINTS automatic 30 30 1 1 1 1 后来又试着运行程序自带的例子，结果输出如下错误： MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 0.NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.You may or may not see output from other processes, depending onexactly when Open MPI kills them. 刚开始用QE，不知道如何处理，请大家帮忙，谢谢！ |
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MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 0.NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes. 从这里来看是编译程序上的问题，mpi出现了问题，你可以先测试一下，用自带的例子。 |
2楼2014-04-22 00:25:29
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我是在Debian上用sudo直接安装的，后来装了个openmpi-bin，然后运行quantum-espresso自带的例子就出现如下错误： MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 0.NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.You may or may not see output from other processes, depending onexactly when Open MPI kills them. |
3楼2014-04-22 22:23:04
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还得麻烦大家一下，我按照mywai520的指点在Ubuntu上安装了QE，测试和运行例子都没有报错，于是我就把其中一个例子拷贝到自己目录中运行了一下，结果得到如下错误： task # 0 from read_namelists : error # 5010 reading namelist system 我的输入文件实际上就是nh4+.in那个例子，下面是具体内容： &CONTROL calculation = 'relax' prefix = "NH", pseudo_dir = "/home/XXX/Program_Files/espresso-5.0.3/pseudo", outdir = "/home/XXX/Workspaces/QE", / &SYSTEM ibrav = 1, celldm(1) = 24.0 nat = 5, ntyp = 2, ecutwfc = 30.D0, ecutrho = 120.D0, do_ee = .true. nelec = 8.0 nbnd = 8 / &ELECTRONS conv_thr = 1.D-7, mixing_beta = 0.7D0, / &IONS / &EE which_compensation='martyna-tuckerman' / ATOMIC_SPECIES N 1.00 N.pbe-paw_kj.UPF H 1.00 H.pbe-paw_kj.UPF ATOMIC_POSITIONS {bohr} N 0.0 0.0 0.0 0 0 0 H 1.0 1.0 1.0 H -1.0 -1.0 1.0 H -1.0 1.0 -1.0 H 1.0 -1.0 -1.0 K_POINTS Gamma 使用的命令是：mpirun -np 4 /home/XXX/Program_Files/espresso-5.0.3/bin/pw.x < nh4+.in > nh4+.out 请大家帮我看看应该如何修改？谢谢！ |
8楼2014-05-06 21:30:04
9楼2014-05-06 21:31:48
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