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zhuimeng08银虫 (正式写手)
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安装gromacs4.6.5 出现问题
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安装好后，运行调用GPU的时候报： 2 GPUs detected: #0: NVIDIA GeForce GTX 560, compute cap.: 2.1, ECC: no, stat: compatible #1: NVIDIA GeForce GTX 560, compute cap.: 2.1, ECC: no, stat: compatible 2 compatible GPUs detected in the system, but none will be used. Consider trying GPU acceleration with the Verlet scheme! 就是调用不起来！ |
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zhuimeng08
银虫 (正式写手)
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- 专业: 药物化学
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NOTE: GPU(s) found, but the current simulation can not use GPUs To use a GPU, set the mdp option: cutoff-scheme = Verlet (for quick performance testing you can use the -testverlet option) 我在.mdp文件中加入 cutoff-scheme = Verlet 后报错 ERROR 1 [file md_gpu.mdp]: With Verlet lists rcoulomb!=rvdw is not supported 我的.mdp文件中这两项明明是不等的。 nstlist = 20 ; 10 fs rlist = 0.9 ; short-range neighborlist cutoff (in nm) rcoulomb = 0.9 ; short-range electrostatic cutoff (in nm) rvdw = 1.4 ; short-range van der Waals cutoff (in nm) cutoff-scheme = Verlet 这是怎么回事？ |
2楼2014-04-21 21:45:40