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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 一株菌在好氧和厌氧下都可以生长，但只在好氧下产生目的产物A，而厌氧下不产，原因？
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bonbonzd

木虫 (小有名气)

[求助] 一株菌在好氧和厌氧下都可以生长，但只在好氧下产生目的产物A，而厌氧下不产，原因？ 已有1人参与

各位虫友，
    我现在有一个课题想设计一下，但是思路不够开阔，你有时间的时候帮我分析一下。实验现象：我手头一株菌在好氧和厌氧下都可以生长，但是只在好氧条件下产生目的产物A，而厌氧下不产，我想挖掘一下什么原因造成的。
    已经有人做过关于这株菌在好氧和厌氧不同条件下的基因表达差异的转录组研究，但也仅仅得出一些基因，在厌氧条件下，下调表达了。这对我的实验有一定的指导意义，但是我想把“这株菌厌氧下可以生长，但不产目的产物A”这一现象的原因搞清楚，希望神通广大的虫友给出一些指导性建议？我最终目的是找到在厌氧下不产目的产物A的原因，去改造它或者添加额外的代谢途径，实现厌氧下可以生产目的产物A。
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1楼 2014-04-21 14:45:07
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bonbonzd

木虫 (小有名气)
谢谢虫友field0073的回复，我的产物A是一类次级代谢产物，不是蛋白。
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5楼2014-04-26 12:31:37
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bonbonzd

木虫 (小有名气)
期待大神给予指点
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2楼2014-04-21 19:08:47
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field0073

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
虫有你好，对于你关注的产物A，是否在其他文献中有过报道，或者同类物质在相关菌种中的有关报道。如果产物A是功能蛋白，可能研究起来相对容易些。你需要寻找到A对应的基因或基因家族，这学要结合同源基因在其他物种中的参考系、。如果确定相关的基因或基因家族，你要控制变量（有氧、无氧）做blot或半定量|定量，幸运的话会找到相关的基因家族成员。蛋白水平也要做相应的blot用来相互验证。
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4楼2014-04-23 15:13:04
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