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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 关于计算得出的WBI键级结果的疑问
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cug_zhang

金虫 (正式写手)

[求助] 关于计算得出的WBI键级结果的疑问已有1人参与

我用Gaussian计算团簇的WBI键级，得到这样一个结果：
Wiberg bond index matrix in the NAO basis:                                    
   1. Si  0.0000  0.1499  0.1181  0.0865  0.7657  0.1671  0.1156  0.6096  0.0698
   2. Si  0.1499  0.0000  0.4733  0.4727  0.6447  0.1503  0.1504  0.1502  0.6456
   3. Si  0.1181  0.4733  0.0000  0.7183  0.0976  0.0861  0.9144  0.0983  0.6143
   4. Si  0.0865  0.4727  0.7183  0.0000  0.6155  0.1179  0.0993  0.9148  0.0976
   5. Si  0.7657  0.6447  0.0976  0.6155  0.0000  0.0699  0.1015  0.4912  0.0677
   6. Si  0.1671  0.1503  0.0861  0.1179  0.0699  0.0000  0.6100  0.1158  0.7666
   7. Si  0.1156  0.1504  0.9144  0.0993  0.1015  0.6100  0.0000  0.2551  0.4902
   8. Si  0.6096  0.1502  0.0983  0.9148  0.4912  0.1158  0.2551  0.0000  0.1019
   9. Si  0.0698  0.6456  0.6143  0.0976  0.0677  0.7666  0.4902  0.1019  0.0000
10. Rh  0.6085  0.0744  0.0971  0.0972  0.0908  0.6080  0.6311  0.6314  0.0908
11. Rh  0.6653  0.6938  0.1137  0.1137  0.1996  0.6647  0.0979  0.0977  0.2005

在这个结果中是不是只存在Si-Si 键级，Si-Rh与Rh-Rh键级不存在？如果存在Si-Rh与Rh-Rh键级，那么该如何计算？如果只存在Si-Si键级，那是不是意味着在该团簇中只有Si-Si键起作用？
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1楼2014-04-20 20:57:47
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youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cug_zhang: 金币+5 2014-04-20 22:09:13
gmy1990: 金币+2 2014-04-20 23:19:08
大哥，你是不是还有一部分没贴出来啊！应该是一个11*11的表啊！中间对角线一条0表示是每个原子和他本身的作用当然为零啊！像第一列左后一行也就是1号硅原子核11号的WBI键级达到了0.6653，你怎么说没有作用呢？
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平生多磨砺，男儿自横行！
2楼2014-04-20 22:02:04
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cug_zhang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by youyno at 2014-04-20 22:02:04
大哥，你是不是还有一部分没贴出来啊！应该是一个11*11的表啊！中间对角线一条0表示是每个原子和他本身的作用当然为零啊！像第一列左后一行也就是1号硅原子核11号的WBI键级达到了0.6653，你怎么说没有作用呢？

谢谢指出我的错误，我确实少看了两列数据，怪不得我觉得数据有些奇怪。
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3楼2014-04-20 22:08:55
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youyno

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cug_zhang at 2014-04-20 22:08:55
谢谢指出我的错误，我确实少看了两列数据，怪不得我觉得数据有些奇怪。...

加油！认真一点就好啦！
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平生多磨砺，男儿自横行！
4楼2014-04-20 22:12:43
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十年磨练

木虫 (正式写手)
你好，我能问一下，在gaussian计算中如何得到WBI键级，是在输入文件中添加关键字NBO吗？
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时刻保持虚心学习的态度
5楼2015-09-01 15:52:23
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cug_zhang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 十年磨练 at 2015-09-01 15:52:23
你好，我能问一下，在gaussian计算中如何得到WBI键级，是在输入文件中添加关键字NBO吗？

输入文件前面：
# rb3lyp/genecp geom=connectivity pop=(nboread,savenbo) scf=maxcycle=400

输入文件最后：

$nbo bndidx $end
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6楼2015-09-04 09:29:18
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十年磨练

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by cug_zhang at 2015-09-04 09:29:18
输入文件前面：
# rb3lyp/genecp geom=connectivity pop=(nboread,savenbo) scf=maxcycle=400

输入文件最后：

$nbo bndidx $end...

嗯，好的，谢谢你。pop=(nboread,savenbo)是什么意思，添加NBO不是在输入文件的前面添加pop=NBO吗?能不能给出一个输入文件的例子，谢谢了
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时刻保持虚心学习的态度
7楼2015-09-05 09:32:40
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