24小时热门版块排行榜    

查看: 2923  |  回复: 6

cug_zhang

金虫 (正式写手)

[求助] 关于计算得出的WBI键级结果的疑问 已有1人参与

我用Gaussian计算团簇的WBI键级,得到这样一个结果:
Wiberg bond index matrix in the NAO basis:                                    
   1. Si  0.0000  0.1499  0.1181  0.0865  0.7657  0.1671  0.1156  0.6096  0.0698
   2. Si  0.1499  0.0000  0.4733  0.4727  0.6447  0.1503  0.1504  0.1502  0.6456
   3. Si  0.1181  0.4733  0.0000  0.7183  0.0976  0.0861  0.9144  0.0983  0.6143
   4. Si  0.0865  0.4727  0.7183  0.0000  0.6155  0.1179  0.0993  0.9148  0.0976
   5. Si  0.7657  0.6447  0.0976  0.6155  0.0000  0.0699  0.1015  0.4912  0.0677
   6. Si  0.1671  0.1503  0.0861  0.1179  0.0699  0.0000  0.6100  0.1158  0.7666
   7. Si  0.1156  0.1504  0.9144  0.0993  0.1015  0.6100  0.0000  0.2551  0.4902
   8. Si  0.6096  0.1502  0.0983  0.9148  0.4912  0.1158  0.2551  0.0000  0.1019
   9. Si  0.0698  0.6456  0.6143  0.0976  0.0677  0.7666  0.4902  0.1019  0.0000
10. Rh  0.6085  0.0744  0.0971  0.0972  0.0908  0.6080  0.6311  0.6314  0.0908
11. Rh  0.6653  0.6938  0.1137  0.1137  0.1996  0.6647  0.0979  0.0977  0.2005

在这个结果中是不是只存在Si-Si 键级,Si-Rh与Rh-Rh键级不存在?如果存在Si-Rh与Rh-Rh键级,那么该如何计算?如果只存在Si-Si键级,那是不是意味着在该团簇中只有Si-Si键起作用?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cug_zhang: 金币+5 2014-04-20 22:09:13
gmy1990: 金币+2 2014-04-20 23:19:08
大哥,你是不是还有一部分没贴出来啊!应该是一个11*11的表啊!中间对角线一条0表示是每个原子和他本身的作用当然为零啊!像第一列左后一行也就是1号硅原子核11号的WBI键级达到了0.6653,你怎么说没有作用呢?
平生多磨砺,男儿自横行!
2楼2014-04-20 22:02:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cug_zhang

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by youyno at 2014-04-20 22:02:04
大哥,你是不是还有一部分没贴出来啊!应该是一个11*11的表啊!中间对角线一条0表示是每个原子和他本身的作用当然为零啊!像第一列左后一行也就是1号硅原子核11号的WBI键级达到了0.6653,你怎么说没有作用呢?

谢谢指出我的错误,我确实少看了两列数据,怪不得我觉得数据有些奇怪。
3楼2014-04-20 22:08:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youyno

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cug_zhang at 2014-04-20 22:08:55
谢谢指出我的错误,我确实少看了两列数据,怪不得我觉得数据有些奇怪。...

加油!认真一点就好啦!
平生多磨砺,男儿自横行!
4楼2014-04-20 22:12:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

十年磨练

木虫 (正式写手)

你好,我能问一下,在gaussian计算中如何得到WBI键级,是在输入文件中添加关键字NBO吗?
时刻保持虚心学习的态度
5楼2015-09-01 15:52:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cug_zhang

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 十年磨练 at 2015-09-01 15:52:23
你好,我能问一下,在gaussian计算中如何得到WBI键级,是在输入文件中添加关键字NBO吗?

输入文件前面:
# rb3lyp/genecp geom=connectivity pop=(nboread,savenbo) scf=maxcycle=400

输入文件最后:

$nbo bndidx $end
6楼2015-09-04 09:29:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

十年磨练

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cug_zhang at 2015-09-04 09:29:18
输入文件前面:
# rb3lyp/genecp geom=connectivity pop=(nboread,savenbo) scf=maxcycle=400

输入文件最后:

$nbo bndidx $end...

嗯,好的,谢谢你。pop=(nboread,savenbo)是什么意思,添加NBO不是在输入文件的前面添加pop=NBO吗?能不能给出一个输入文件的例子,谢谢了
时刻保持虚心学习的态度
7楼2015-09-05 09:32:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cug_zhang 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +10 Isak0320 2026-10-12 14/700 2026-10-14 11:39 by thegarfield
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 12/600 2026-10-13 20:40 by Merryya
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见