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问天麦饼

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[求助] 分析z方向的电荷转移的工具已有1人参与

正在用vasp做表面体系，想做出差分电荷密度数值随z变化的关系图，以反映表面加上O缺陷后电荷转移的情况，如图1。现在搜到一下几种软件：
1.VASPview。我不太会用，只能看到它会做截面。到底能不能做电荷密度在某一个方向上的分布呢？
2.VESTA 和上一个软件一样，我在Utilities- 2D data display中只能看到截面，如图2，但是如何做图1那样的图呢？
3.是否有其它软件？

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1楼 2014-04-20 16:11:05

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mywai520

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【答案】应助回帖

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感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+10, 谢谢提供脚本。。 2014-04-21 23:53:29
问天麦饼: 金币+10 2014-04-23 10:05:33
franch: 回帖置顶 2014-05-05 22:58:19

这个图需要自己写脚本解决，我这里写了一个python,借你用用。
#!/usr/bin/env python

from chargedensity import *
import numpy as np

a = ChargeDensity("CHG",format_="chgcar"

den_z = a.integrate_z_density()
z_pos = np.linspace(0,a.unitcell.cell_vec[2,2],len(den_z))
print len(den_z)
for i in range(len(den_z)):
print z_pos,den_z

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2楼2014-04-20 18:14:07

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问天麦饼

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引用回帖:

2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-20 18:14:07
这个图需要自己写脚本解决，我这里写了一个python,借你用用。
#!/usr/bin/env python

from chargedensity import *
import numpy as np

a = ChargeDensity("CHG",format_="chgcar"

...

python神马的不懂……能写成个bash吗？