10楼: Originally posted by huyingdamon at 2014-06-23 21:02:25
就是小分子的top你是怎么获得的呢，我去年学的GMX，小分子top不知道怎么得到，后来看到用PRODRG，可是好像这样得到的电荷有错误，模拟时基本都会出问题。不知道你是怎么得到小分子top的。谢谢哈...

11楼: Originally posted by 水儿CoCo at 2014-06-25 15:09:39
电荷是不准确的，电荷组也是，我是用高斯计算然后自己更改的，文件形式一致就好，电荷是可以改的...

12楼: Originally posted by huyingdamon at 2014-06-26 22:34:10
其他的都不该 就改电荷就可以是吗 还有高斯我没用过 那个计算电荷难吗 在win7下可以使用吗。我今天模拟了下，是通过prodrg得到的top,本来去年模拟都会提示电荷或者电荷组有错误，这次居然没提示，10 ns 的MD模拟都 ...