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求助群体显著性差异比较方法已有1人参与
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在已知多个群体基因座等位基因频率的情况下如何，如何计算群体间显著性差异的p值？或者能用什么软件，我用卡方检验试了结果不对（我用了R*C单向有序资料方法），哪位高手能否指点一二。(如下表P值，想知道这是怎么算出来的） Locus Uygur vs. Salar Ewenki Tibeta n Tu Han Yi India Iraq Pakistan Palestinian Turkey Nepal East Mongolia n D18S51 0.000 0.000 0.000 0.445 0.000 0.008 0.000 0.010 0.020 0.000 0.240 0.000 0.002 D21S11 0.000 0.091 0.000 0.612 0.029 0.000 0.000 0.007 0.000 0.001 0.005 0.001 0.001 D19S433 0.013 0.022 0.001 0.033 0.000 0.006 0.000 0.000 — — — 0.003 — D2S1338 0.000 0.000 0.000 0.000 0.082 0.000 0.000 0.000 — — — 0.000 — TH01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.017 0.155 0.031 0.001 0.000 0.000 D3S1358 0.000 0.103 0.000 0.091 0.211 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 — 0.002 0.265 VWA 0.000 0.000 0.003 0.001 0.005 0.000 0.000 0.001 0.062 0.000 0.018 0.000 0.000 CSF1PO 0.014 0.005 0.002 0.273 0.008 0.008 0.000 0.445 0.366 0.003 0.004 0.000 0.067 D5S818 0.000 0.127 0.452 0.115 0.002 0.048 0.000 0.016 0.003 0.001 0.063 0.000 0.003 TPOX 0.001 0.441 0.000 0.026 0.233 0.467 0.000 0.003 0.001 0.029 0.006 0.000 0.182 D13S317 0.000 0.000 0.030 0.001 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.013 0.000 0.001 D7S820 0.066 0.001 0.031 0.000 0.000 0.001 0.014 0.005 1.000 0.041 0.147 0.000 0.024 D16S539 0.002 0.012 0.008 0.650 0.012 0.501 0.281 0.001 0.359 0.565 0.000 0.000 0.263 D8S1179 0.000 0.038 0.004 0.259 0.001 0.000 0.000 0.001 0.000 0.029 0.396 0.000 0.198 FGA 0.000 0.338 0.000 0.001 0.000 0.000 0.000 0.003 0.000 0.001 0.000 0.000 1.000 |
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【答案】应助回帖
 我算是找到了，纠结了一两周，给你说说吧。就是用spss做的卡方检验。不过对于原始数据，需要的是频数而不是频率（你可以个体数乘以2再乘以频率，对应出频数）。然后就是需要你在spss里抄作了！有个示范：http://wenku.baidu.com/link?url= ... WsxgNcaQymO-bA7cP9_加油吧！学生物还要奔跑在统计学里的孩子！ |
3楼2015-04-23 09:31:20
【答案】应助回帖
 最近我也在找这个，不过还没确切的答案！ 最多的解释就是：采用G—test(P<O.05)比较了XX与XX等位基因频率的差异。 然后找到这个： Parental contributions were also compared between crosses and between samplingdays using G tests. x 2 and G tests were computed using SYSTAT 9.0Ž SPSS..也就是说用spss9.0 的G test 可以搞定！ 但是，我一直没找到G test 指的什么方法！ 仅此参考！希望有用! |
2楼2015-04-20 16:14:44