应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 大四科研小白，读研准备做分子模拟，毫无头绪，求各位老师前辈引路
181/2返回列表12下一页
查看: 1948  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

cunjiehaha

新虫 (初入文坛)

[求助] 大四科研小白，读研准备做分子模拟，毫无头绪，求各位老师前辈引路 已有4人参与

我本科学的是能源与环境，具体是热能方向。确定留校读研，导师叫我做分子模拟，推荐我用Gromacs。可是翻了两页用户手册，实在看不下去了，感觉有很多基础理论知识都不懂。自己找了很多资料看得晕晕乎乎，希望得到各位前辈指点，推荐书目、方法皆可。在此谢过各位了！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2014-04-07 22:04:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-04-13 09:05:10
猜你是热能系的。

直博吧。

把分子模拟干翻！

搞研究是为了什么？总要坚持做好一件自认为不可能的事情，奠定你的人生高度。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2014-04-07 22:28:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-04-08 18:56:51
别着急别着急
过几天我毕业了有空把分子模拟软件(lammps NAMD gromacs )入门之路都告知大家。
提前求祝福！

gromacs 入门先看网上的教程，一步一步地跟着教程走一遍，先有个大概了解，然后把教程中用到的命令搞懂(看手册)，等你把教程走一遍之后，如果觉得掌握差不多了，可以找篇简单一点儿的文献，试试重复人家的结果，如果能重复出来，你基本上就可以搞自己的研究内容了。

祝福好运
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2014-04-07 22:51:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7226974&pid=1#pid1
This will be helpful.
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2014-04-07 22:46:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
引用回帖:
6楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-04-07 22:58:43
区长来拆台啊！
哈哈哈，看到这个帖子我觉得好幸运啊，以前还妄想毕业后去国外做博后，现在果断改行。...

我也不是要拆台，
而是命运左右着你我。越往后来，越会发现自己对未来失去控制力。
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2014-04-07 23:15:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huachao90

禁虫 (正式写手)
★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流，但非应助回帖，请勿选择应助。 2014-04-13 09:06:07
月只蓝: 应助指数-1 2014-04-13 09:33:58
本帖内容被屏蔽
14楼2014-04-08 00:55:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

朱雪刚521

铁杆木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-04-13 09:06:27
学软件，要么是逼出来的，要么是兴趣。如果你兴趣不高那就逼自己一把吧。现在在学lammps，在网上大概了解了一些再看手册感觉轻松了好多。还没涉及到Gromacs。也许以后会学。现在研一。
赞一下(1人) 回复此楼
17楼2014-04-11 16:07:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

cunjiehaha

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cenwanglai at 2014-04-07 22:28:14
猜你是热能系的。

直博吧。

把分子模拟干翻！

搞研究是为了什么？总要坚持做好一件自认为不可能的事情，奠定你的人生高度。

确实想搞懂！一知半解很不爽
赞一下 回复此楼
3楼2014-04-07 22:35:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cenwanglai at 2014-04-07 22:46:18
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7226974&pid=1#pid1
This will be helpful.

区长来拆台啊！
哈哈哈，看到这个帖子我觉得好幸运啊，以前还妄想毕业后去国外做博后，现在果断改行。
赞一下 回复此楼
6楼2014-04-07 22:58:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
引用回帖:
6楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-04-07 22:58:43
区长来拆台啊！
哈哈哈，看到这个帖子我觉得好幸运啊，以前还妄想毕业后去国外做博后，现在果断改行。...

jiaoyixiong,请教一下，

GROMACS里面有算velocity auto- and cross-correlation functions的工具吗？
赞一下 回复此楼
7楼2014-04-07 23:13:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cunjiehaha

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cenwanglai at 2014-04-07 22:46:18
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7226974&pid=1#pid1
This will be helpful.

好深沉的帖子
回复此楼
8楼2014-04-07 23:14:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
7楼: Originally posted by cenwanglai at 2014-04-07 23:13:13
jiaoyixiong,请教一下，

GROMACS里面有算velocity auto- and cross-correlation functions的工具吗？...

好高端的问题啊，我不懂！没有听说过，没有用过这样的工具。
赞一下 回复此楼
10楼2014-04-07 23:23:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cunjiehaha 的主题更新
181/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 3/150 2026-11-10 01:40 by FChKX8meu1ds
[考博] 27博士申请 +3 白白白ly 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:39 by szq0819
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 12/600 2026-11-09 13:26 by Equinoxhua
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 08:00 by IhnEQauGmT3K
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 延安大学回应“副教授留绝笔信”：确已离世，正核实举报内容 +3 yexuqing 2026-11-04 5/250 2026-11-07 13:22 by 苏东坡二世
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭