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wybiology

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[求助] 请问WB做成这样,说明人品已经极差了吗?已有1人参与

各位大虫,中午好!
我做WB,上了5个泳道,实验结果如图,是内参蛋白H3(histone H3,14kDa)和目的蛋白(是两个条带,42kDa和38kDa),蓝色为marker(第一个图是内参的,第二个图是目的蛋白的)。我跑胶了以后没有考染,直接做WB,做出来这样的结果。解释不了为什么会是这样的结果?marker是好的,说明不是胶的问题。蛋白上样量150微克(上样量不能再少了,再少的话我的目的条带就不清晰了)。而我的目的蛋白WB以后出来还算勉强,但有点模糊和拖尾。所以我觉得极可能是蛋白的问题。
因为我不想上样体积太大,总体积约为20微升,所以我打算是10微的蛋白溶液和10微的2×SDS loading buffer,但是最后蛋白上样量保证150微克的条件下,蛋白上样体积就会超过10微甚至达到16微,然后剩余的体积我就把加2×SDS buffer补足20微,这会导致上样前煮沸的过程中蛋白没有溶解好或没有完全溶解吗,会造成这样的结果吗?
提取的植物总蛋白,然后用很剧烈的方式振荡溶解的,这样会对蛋白有什么影响吗?
感谢有经验的大虫,解答问题,如果还有可能其他的原因导致这样的结果,请提供您的宝贵建议或意见,谢谢!

请问WB做成这样,说明人品已经极差了吗?
内参蛋白H3.jpg


请问WB做成这样,说明人品已经极差了吗?-1
目的蛋白.jpg
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wybiology

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引用回帖:
4楼: Originally posted by wybiology at 2014-04-24 21:07:42
WB已经做完一段时间,突然想起来当初留下的这个问题。

后来的解决方案主要如下:

第一,SDS loading buffer一定要按照体积加入,切勿忽视。

第二,蛋白上样量还是适当减少,上样体积也不要过多,我把20微上 ...

为什么刚才不能传图片,never mind.
见下图,
请问WB做成这样,说明人品已经极差了吗?-2
target protein.jpg


请问WB做成这样,说明人品已经极差了吗?-3
H3 .jpg

5楼2014-04-24 21:20:55
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d00614028

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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wybiology(youlinglyw代发): 金币+2 2014-04-03 14:58:51
内参出现弯曲的现象应该是由于你跑胶的时候跑到太底了吧,底部的胶布均匀,而且你的内参的抗体可以少加点,曝光的时候曝光时间减短。因为内参只有14K,建议配13%-15%的胶,不要跑到太底。
2楼2014-04-03 12:27:28
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wybiology

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引用回帖:
2楼: Originally posted by d00614028 at 2014-04-03 12:27:28
内参出现弯曲的现象应该是由于你跑胶的时候跑到太底了吧,底部的胶布均匀,而且你的内参的抗体可以少加点,曝光的时候曝光时间减短。因为内参只有14K,建议配13%-15%的胶,不要跑到太底。

跑胶没有跑到太底,这个我比较确定。因为之前做过几次WB都没有出现过这样的情况,这次唯一不同的就是2×SDS lb的使用量不足。所以我在担心以后是否还会出现同样的状况。内参抗体的稀释倍数确实需要在提高一些。谢谢您的建议。是否还可能有其他的影响因素呢?
3楼2014-04-03 14:38:56
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wybiology

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WB已经做完一段时间,突然想起来当初留下的这个问题。

后来的解决方案主要如下:

第一,SDS loading buffer一定要按照体积加入,切勿忽视。

第二,蛋白上样量还是适当减少,上样体积也不要过多,我把20微上样体积改成了10微。主要考虑是这样跑胶的结果会比较好很多,当然对WB显色没有太多影响,毕竟抗体对目的蛋白的信号放大是数量级的。反而条带显色更好。

第三,抗体的稀释比例,对于我的实验来讲特别是内参的比例很重要,由于使用的国外比较好的公司的抗体,所以效价确实高,最后H3的考题稀释比例是1:40000。

最后有图有真相,上图给需要的朋友参考。
4楼2014-04-24 21:07:42
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