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花神之息

铜虫 (小有名气)

[求助] 一个细胞内大概有多少启动子?(2014/3/30) 已有6人参与

题目很不专业,求原谅。。。
本人没学过生物,但是现在非常需要一些DNA结构,基因表达机理的相关信息。
我是在做这样一项事情:用微分方程及反应动力学等工具模拟目标蛋白的转录及翻译过程。
大概过程是:转录因子与DNA上某个表达位点结合,转录出相应的mRNA,mRNA翻译成蛋白质。
由于是一个半定量模拟,所涉及到的物质必须都以浓度或数量表示,现在遇到的问题是:
DNA上某一种特定基因的结合位点(binding sites),其数量或浓度,是一个什么数量级?
(注:某一种特定基因就是指,比如蛋白质A所对应的基因位点,而不考虑其他蛋白质表达位点。)

急需,在线等啊,求大神。。。
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花神之息

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by liuderong at 2014-03-30 23:25:14
如果按一个基因一个启动子计算,那大肠杆菌大概是4000,酵母约6000,果蝇1万5不到,人类是2-3万,植物可能会比人类多一点。不同的物种基因数不一样的,你如果不说明“一个细胞”是什么细胞,那就不好定了。转录因子 ...

灰常灰常感谢这位朋友,其实我只要知道一个大概数量级就行了,比如10e-3到10e-5
17楼2014-03-31 09:26:19
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花神之息

铜虫 (小有名气)

灌水也行啊 求给点看法
2楼2014-03-30 20:58:50
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

一个基因一个启动子,你可以想象一下

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-03-30 21:07:09
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花神之息

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Fleaves at 2014-03-30 21:07:09
一个基因一个启动子,你可以想象一下

DNA/基因、启动子、表达位点这些概念我真的不是很清楚。
不过,根据生物实验文献,我设想的情况大概是这样的:DNA是一根长长的线,线上游很多特定的点,核内转录因子都游离在线的周围,转录因子只有结合到这些点上,才能触发表达事件。所以这些点应该也可以用数量表达。。。
只是我自己想的
4楼2014-03-30 21:13:15
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