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junjun0711

新虫 (小有名气)

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[求助] 求助，我想把KEGG中的通路导入cytocape中，请会的前辈指教啊已有1人参与

我想把KEGG通路导入cytoscape中，看看我们研究的一些靶点蛋白在通路中的一些情况，不知道怎么能画出这样的通路图~~请教相关生物信息学的前辈
。

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1楼 2014-03-27 10:59:04

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stoneprince1979

木虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

看到您很早前发的帖子，不知道您现在用的是哪个版本的，目前cytoscape 3.2.1版本的直接有个app，其下拉菜单中有app manager，点击后会出现一个菜单，中间有些模块可以在线安装，点击kegg就可以下载安装到cytoscape中去了，当安装成功后，在软件的左边区域有个cytokegg按钮，点击后会发现有browser pathway，点击这个按钮后会有另一个菜单提示你需要的，一般包括：种属、信号通路名称，点击加载就可以再视图区域看到了。希望有用！