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junjun0711

新虫 (小有名气)

[求助] 求助,我想把KEGG中的通路导入cytocape中,请会的前辈指教啊已有1人参与

我想把KEGG通路导入cytoscape中,看看我们研究的一些靶点蛋白在通路中的一些情况,不知道怎么能画出这样的通路图~~请教相关生物信息学的前辈
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stoneprince1979

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

看到您很早前发的帖子,不知道您现在用的是哪个版本的,目前cytoscape 3.2.1版本的直接有个app,其下拉菜单中有app manager,点击后会出现一个菜单,中间有些模块可以在线安装,点击kegg就可以下载安装到cytoscape中去了,当安装成功后,在软件的左边区域有个cytokegg按钮,点击后会发现有browser pathway,点击这个按钮后会有另一个菜单提示你需要的,一般包括:种属、信号通路名称,点击加载就可以再视图区域看到了。希望有用!
2楼2015-08-27 22:16:52
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

没事领金币

留名,以后会用到,学习了
上邪!我欲与君相知,长命无绝衰。山无陵,江水为竭,冬雷震震,夏雨雪,天地合,乃敢与君绝!
3楼2015-08-29 13:46:30
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