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cham208

木虫 (正式写手)

[求助] CIF有B类错误,求帮忙修改 已有1人参与

很早前的一个晶体,最近投稿审稿人说有B类错误,请高手帮忙修改,不胜感激!
可发我邮箱:fxdmlzm@163.com

错误如下:
PLAT029_ALERT_3_B   _diffrn_measured_fraction_theta_full Low ....... 0.959 Note
PLAT222_ALERT_3_B   Large Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 8.8 Ratio
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  • 2014-03-27 10:43:44, 649.27 K

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forever1706

禁虫 (知名作家)

引用回帖:
10楼: Originally posted by p452_1 at 2014-03-28 19:27:01
晶体如果是你自己测的,当然你可以设置最合适的分表率。如果是别人测的,你解析结构,XPREP后会产生prp文件,可以查看prp文件,可以看到衍射数据的分表率以及对应的数据完整度、重复度以及Rint值等。...

既然您是行家, 我就继续问了,这个分辨率在cif中体现在什么地方,键长的精度?它可能会影响到checkcif的哪些问题。刚看一个我解过的数据,在prp文件接近末尾的位置找到  lowest resolution = 16.16 Angstroms。

这个晶体质量还不错,checkcif的时候有G类错误:

PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details in the CIF Please Do !
PLAT232_ALERT_2_G Hirshfeld Test Diff (M-X) Co1 -- S1 .. 8.5 su
PLAT764_ALERT_4_G Overcomplete CIF Bond List Detected (Rep/Expd) . 1.16 Ratio

其中第二个Hirshfeld错误有挺多,都是金属跟相关的键。
这个Hirshfeld是什么原因引起的,好像经常遇到,有时候会到C类甚至B类。怎么解决呢?
12楼2014-03-29 18:03:56
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

少一个hkl文件,没有办法精修。估计是需要使用omit -3 50.2命令,Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 8.8 Ratio可能是有氢原子需要dfix
2楼2014-03-27 16:16:31
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cham208

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ljmmarise at 2014-03-27 16:16:31
少一个hkl文件,没有办法精修。估计是需要使用omit -3 50.2命令,Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 8.8 Ratio可能是有氢原子需要dfix

我找不到hkl文件了,还有其它办法吗?多谢
3楼2014-03-27 16:42:04
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
cham208: 金币+50, ★有帮助 2014-03-27 19:38:53
需要找到数据文件hkl文件和fcf文件等,在ins文件中加入适当的命令,进行精修。有可能去掉这2个B类问题。
老歪博
4楼2014-03-27 18:32:03
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